09.04.2009 18:00 1. FC Schweinfurt 05 - TSV 1896 Rain 2:1
11.04.2009 15:00 SpVgg Bayreuth - SpVgg Ansbach 0:0
15:00 FC Ingolstadt 04 II - SpVgg Weiden 0:2
15:00 TSV Aindling - Würzburger Kickers 3:2
15:00 VfL Frohnlach - SV Seligenporten 1:1
15:00 FC Memmingen - SpVgg Bayern Hof 1:0
15:00 Würzburger FV - FSV Erlangen-Bruck 1:1
15:00 FC Ismaning - 1. FC Bad Kötzting 1:2
17:00 TSV Buchbach - TSG Thannhausen 2:0
» Tabelle Heim Auswärts Hinrunde Rückrunde
# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SpVgg Weiden, Deutschland SpVgg Weiden 27 18 6 3 49:24 25 60
2 TSV Aindling, Deutschland TSV Aindling 27 15 8 4 58:24 34 53
3 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 27 13 9 5 41:26 15 48
4 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 27 13 6 8 33:27 6 45
5 FSV Erlangen-Bruck, Deutschland FSV Erlangen-Bruck 27 12 8 7 48:33 15 44
6 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 27 10 8 9 39:36 3 38
7 FC Ingolstadt 04 II, Deutschland FC Ingolstadt 04 II 27 10 8 9 34:34 0 38
8 FC Ismaning, Deutschland FC Ismaning 27 11 3 13 52:46 6 36
9 SpVgg Bayern Hof, Deutschland SpVgg Bayern Hof 27 10 6 11 36:33 3 36
10 SpVgg Ansbach, Deutschland SpVgg Ansbach 27 9 9 9 32:34 -2 36
11 1. FC Bad Kötzting, Deutschland 1. FC Bad Kötzting 27 10 6 11 39:46 -7 36
12 VfL Frohnlach, Deutschland VfL Frohnlach 27 10 5 12 48:46 2 35
13 TSG Thannhausen, Deutschland TSG Thannhausen 27 10 4 13 42:45 -3 34
14 SV Seligenporten, Deutschland SV Seligenporten 27 5 14 8 30:41 -11 29
15 TSV 1896 Rain, Deutschland TSV 1896 Rain 27 7 6 14 35:55 -20 27
16 Würzburger FV, Deutschland Würzburger FV 27 5 11 11 36:48 -12 26
17 Würzburger Kickers, Deutschland Würzburger Kickers 27 7 2 18 42:66 -24 23
18 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 27 6 5 16 29:59 -30 23

# Erstmals seit der Saison 1977/78 beendeten drei Teams in der Abstiegszone die Saison punktgleich. Daher mussten zwischen dem TSV Rain am Lech, dem Würzburger FV und dem FV Seligenporten drei Entscheidungsspiele um Klassenerhalt, Relegation bzw. Abstieg ausgetragen werden. Aufsteiger Rain siegte 2:0 gegen Würzburg und 5:1 gegen Seligenporten und hielt so die Klasse. Im dritten Spiel gewann Seligenporten 4:0 gegen Würzburg, womit nach den Kickers auch der zweite Würzburger Verein absteigen musste. Seligenporten sicherte schließlich in den Relegationsspielen die Zugehörigkeit zur Bayernliga.
Bayernliga (1994-2012)
Bayernliga (1994-2012)