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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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1. FC Lok Leipzig | 13 | 11 | 2 | 0 | 38:5 | 33 | 35 |
| 2 |
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Inter Leipzig | 13 | 9 | 3 | 1 | 36:11 | 25 | 30 |
| 3 |
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FC Carl Zeiss Jena II | 13 | 8 | 2 | 3 | 36:14 | 22 | 26 |
| 4 |
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Bischofswerdaer FV | 12 | 7 | 3 | 2 | 27:16 | 11 | 24 |
| 5 |
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Energie Cottbus II | 13 | 7 | 2 | 4 | 34:24 | 10 | 23 |
| 6 |
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VFC Plauen | 13 | 6 | 4 | 3 | 30:18 | 12 | 22 |
| 7 |
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SSV Markranstädt | 14 | 6 | 4 | 4 | 24:13 | 11 | 22 |
| 8 |
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FSV Barleben | 14 | 6 | 4 | 4 | 25:18 | 7 | 22 |
| 9 |
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VfL Halle 96 | 13 | 6 | 3 | 4 | 25:18 | 7 | 21 |
| 10 |
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Rot-Weiß Erfurt II | 13 | 5 | 4 | 4 | 27:16 | 11 | 19 |
| 11 |
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SV SCHOTT Jena | 12 | 6 | 1 | 5 | 22:29 | -7 | 19 |
| 12 |
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Askania Bernburg | 13 | 5 | 3 | 5 | 16:13 | 3 | 18 |
| 13 |
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FC Einheit Rudolstadt | 13 | 5 | 3 | 5 | 16:14 | 2 | 18 |
| 14 |
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Union Sandersdorf | 13 | 4 | 4 | 5 | 19:23 | -4 | 16 |
| 15 |
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BSG Wismut Gera | 13 | 3 | 2 | 8 | 14:25 | -11 | 11 |
| 16 |
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FC Eisenach | 13 | 2 | 1 | 10 | 7:37 | -30 | 7 |
| Aufstieg | |
| Abstieg |
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# Rot-Weiß Erfurt II und Energie Cottbus II wurden zum Saisonende zurückgezogen. Dadurch verringerte sich die Zahl der sportlichen Absteiger. # Der FC Eisenach beantragte für die Saison 2016/2017 keine Oberligalizenz |
