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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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1. FC Lok Leipzig | 14 | 11 | 3 | 0 | 39:6 | 33 | 36 |
| 2 |
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Inter Leipzig | 14 | 10 | 3 | 1 | 41:11 | 30 | 33 |
| 3 |
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FC Carl Zeiss Jena II | 15 | 8 | 3 | 4 | 38:18 | 20 | 27 |
| 4 |
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Bischofswerdaer FV | 14 | 8 | 3 | 3 | 31:19 | 12 | 27 |
| 5 |
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FSV Barleben | 15 | 7 | 4 | 4 | 30:19 | 11 | 25 |
| 6 |
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VfL Halle 96 | 15 | 7 | 4 | 4 | 27:19 | 8 | 25 |
| 7 |
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Energie Cottbus II | 15 | 7 | 3 | 5 | 38:29 | 9 | 24 |
| 8 |
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SSV Markranstädt | 15 | 6 | 5 | 4 | 26:15 | 11 | 23 |
| 9 |
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VFC Plauen | 15 | 6 | 5 | 4 | 32:23 | 9 | 23 |
| 10 |
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Rot-Weiß Erfurt II | 15 | 6 | 4 | 5 | 30:22 | 8 | 22 |
| 11 |
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SV SCHOTT Jena | 14 | 7 | 1 | 6 | 25:33 | -8 | 22 |
| 12 |
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Union Sandersdorf | 15 | 5 | 5 | 5 | 22:24 | -2 | 20 |
| 13 |
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FC Einheit Rudolstadt | 14 | 5 | 4 | 5 | 18:16 | 2 | 19 |
| 14 |
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Askania Bernburg | 14 | 5 | 3 | 6 | 16:18 | -2 | 18 |
| 15 |
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BSG Wismut Gera | 14 | 4 | 2 | 8 | 15:25 | -10 | 14 |
| 16 |
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FC Eisenach | 14 | 2 | 1 | 11 | 8:40 | -32 | 7 |
| Aufstieg | |
| Abstieg |
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# Rot-Weiß Erfurt II und Energie Cottbus II wurden zum Saisonende zurückgezogen. Dadurch verringerte sich die Zahl der sportlichen Absteiger. # Der FC Eisenach beantragte für die Saison 2016/2017 keine Oberligalizenz |
