# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 1. FC Lok Leipzig, Deutschland 1. FC Lok Leipzig 15 10 5 0 34:6 28 35
2 Bischofswerdaer FV, Deutschland Bischofswerdaer FV 15 7 6 2 23:11 12 27
3 Inter Leipzig, Deutschland Inter Leipzig 15 8 3 4 26:16 10 27
4 FC Einheit Rudolstadt, Deutschland FC Einheit Rudolstadt 15 7 5 3 26:15 11 26
5 Union Sandersdorf, Deutschland Union Sandersdorf 15 7 2 6 26:24 2 23
6 FC Carl Zeiss Jena II, Deutschland FC Carl Zeiss Jena II 15 6 4 5 34:24 10 22
7 Askania Bernburg, Deutschland Askania Bernburg 15 5 5 5 26:24 2 20
8 VfL Halle 96, Deutschland VfL Halle 96 15 5 3 7 33:31 2 18
9 SSV Markranstädt, Deutschland SSV Markranstädt 15 5 3 7 23:33 -10 18
10 Energie Cottbus II, Deutschland Energie Cottbus II 15 5 1 9 18:37 -19 16
11 FSV Barleben, Deutschland FSV Barleben 15 4 3 8 22:28 -6 15
12 VFC Plauen, Deutschland VFC Plauen 15 4 2 9 15:43 -28 14
13 Rot-Weiß Erfurt II, Deutschland Rot-Weiß Erfurt II 15 3 3 9 19:43 -24 12
14 SV SCHOTT Jena, Deutschland SV SCHOTT Jena 15 2 3 10 13:32 -19 9
15 BSG Wismut Gera, Deutschland BSG Wismut Gera 15 0 4 11 12:40 -28 4
16 FC Eisenach, Deutschland FC Eisenach 15 0 1 14 9:55 -46 1
  Aufstieg
  Abstieg

# Rot-Weiß Erfurt II und Energie Cottbus II wurden zum Saisonende zurückgezogen. Dadurch verringerte sich die Zahl der sportlichen Absteiger.

# Der FC Eisenach beantragte für die Saison 2016/2017 keine Oberligalizenz