DFB-Nachwuchsliga   Sp. S U N Tore
  Zu Hause 1 0 1 0 1 : 1
  Auswärts 1 1 0 0 2 : 0
  2 1 1 0 3 : 1
Bundesliga Nord/Nordost   Sp. S U N Tore
  Zu Hause 9 3 3 3 15 : 15
  Auswärts 7 3 2 2 14 : 8
  16 6 5 5 29 : 23
GESAMT   Sp. S U N Tore
  Zu Hause 10 3 4 3 16 : 16
  Auswärts 8 4 2 2 16 : 8
  Neutraler Ort 0 0 0 0 0 : 0
  18 7 6 5 32 : 24
DFB-Nachwuchsliga
2024/2025 Vorrunde Gruppe B 1. FC Union Berlin - FC St. Pauli 0:2 (0:2)
2024/2025 Vorrunde Gruppe B FC St. Pauli - 1. FC Union Berlin 1:1 (0:0)
Bundesliga Nord/Nordost
2023/2024 22. Spieltag FC St. Pauli - 1. FC Union Berlin 0:1 (0:1)
2023/2024 9. Spieltag 1. FC Union Berlin - FC St. Pauli 3:1 (1:0)
2022/2023 7. Spieltag FC St. Pauli - 1. FC Union Berlin 3:3 (0:1)
2021/2022 12. Spieltag 1. FC Union Berlin - FC St. Pauli 2:1 (0:0)
2020/2021 1. Spieltag FC St. Pauli - 1. FC Union Berlin 5:2 (1:0)
2019/2020 9. Spieltag FC St. Pauli - 1. FC Union Berlin 1:1 (1:1)
2018/2019 25. Spieltag 1. FC Union Berlin - FC St. Pauli 1:2 (1:2)
2018/2019 12. Spieltag FC St. Pauli - 1. FC Union Berlin 3:1 (1:1)
2017/2018 15. Spieltag FC St. Pauli - 1. FC Union Berlin 0:3 (0:1)
2017/2018 2. Spieltag 1. FC Union Berlin - FC St. Pauli 0:3 (0:0)
2013/2014 22. Spieltag FC St. Pauli - 1. FC Union Berlin 0:2 (0:0)
2013/2014 9. Spieltag 1. FC Union Berlin - FC St. Pauli 0:5 (0:1)
2011/2012 26. Spieltag 1. FC Union Berlin - FC St. Pauli 2:2 (2:1)
2011/2012 13. Spieltag FC St. Pauli - 1. FC Union Berlin 1:0 (0:0)
2008/2009 16. Spieltag 1. FC Union Berlin - FC St. Pauli 0:0 (0:0)
2008/2009 3. Spieltag FC St. Pauli - 1. FC Union Berlin 2:2 (0:0)

Für Spiele, die im Elfmeterschießen entschieden wurden, geht der Spielstand nach 120 Minuten in diese Wertung ein.