1. Spieltag 24.07.2015 VfB Auerbach - FC Carl Zeiss Jena 0:3
2. Spieltag 05.08.2015 FC Carl Zeiss Jena - FC Schönberg 95 0:0
3. Spieltag 15.08.2015 BFC Dynamo - FC Carl Zeiss Jena 1:2 gelbe Karte
4. Spieltag 23.08.2015 FC Carl Zeiss Jena - FC Viktoria 1889 Berlin 2:0
5. Spieltag 26.08.2015 ZFC Meuselwitz - FC Carl Zeiss Jena 2:0
6. Spieltag 02.09.2015 FC Carl Zeiss Jena - FSV Budissa Bautzen 0:0
7. Spieltag 13.09.2015 Optik Rathenow - FC Carl Zeiss Jena 1:2
8. Spieltag 20.09.2015 FC Carl Zeiss Jena - FSV 63 Luckenwalde 4:0
9. Spieltag 27.09.2015 Wacker Nordhausen - FC Carl Zeiss Jena 0:0 gelbe Karte
10. Spieltag 04.10.2015 FC Carl Zeiss Jena - TSG Neustrelitz 2:0
11. Spieltag 18.10.2015 Hertha BSC II - FC Carl Zeiss Jena 0:0
12. Spieltag 23.10.2015 FC Carl Zeiss Jena - Berliner AK 07 3:1 gelbe Karte
13. Spieltag 01.11.2015 RB Leipzig II - FC Carl Zeiss Jena 0:1
14. Spieltag 08.11.2015 FC Carl Zeiss Jena - FC Oberlausitz 2:0
15. Spieltag 20.11.2015 SV Babelsberg 03 - FC Carl Zeiss Jena 0:0
16. Spieltag 29.11.2015 FC Carl Zeiss Jena - FSV Zwickau 0:1 rote Karte
21. Spieltag 21.02.2016 FC Viktoria 1889 Berlin - FC Carl Zeiss Jena 2:1
22. Spieltag 27.02.2016 FC Carl Zeiss Jena - ZFC Meuselwitz 0:2 gelbe Karte
23. Spieltag 06.03.2016 FSV Budissa Bautzen - FC Carl Zeiss Jena 0:2
24. Spieltag 13.03.2016 FC Carl Zeiss Jena - Optik Rathenow 3:2
29. Spieltag 19.04.2016 Berliner AK 07 - FC Carl Zeiss Jena 1:0
31. Spieltag 29.04.2016 FC Oberlausitz - FC Carl Zeiss Jena 1:1
33. Spieltag 15.05.2016 FSV Zwickau - FC Carl Zeiss Jena 2:0
34. Spieltag 21.05.2016 FC Carl Zeiss Jena - Germania Halberstadt 5:2