03.05.2013 18:30 SpVgg Hankofen-Hailing - Jahn Regensburg II 2:1 (1:1)
04.05.2013 14:00 FC Unterföhring - SC Fürstenfeldbruck 3:2 (2:2)
15:00 SB DJK Rosenheim - TSV Schwabmünchen 1:0 (0:0)
15:00 TSV Gersthofen - SpVgg Unterhaching II 1:0 (0:0)
15:00 SV Schalding-Heining - BCF Wolfratshausen 1:0 (0:0)
15:00 1. FC Sonthofen - SpVgg Landshut 2:2 (1:0)
17:00 BC Aichach - VfB Eichstätt 3:0 (1:0)
05.05.2013 13:15 Wacker Burghausen II - TSV Aindling 2:0 (2:0)
17:00 FC Affing - TSV Kottern-St. Mang 1:0 (1:0)
# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 33 22 6 5 53:21 32 72
2 Wacker Burghausen II, Deutschland Wacker Burghausen II 33 18 4 11 58:33 25 58
3 BC Aichach, Deutschland BC Aichach 33 17 5 11 63:35 28 56
4 SpVgg Unterhaching II, Deutschland SpVgg Unterhaching II 33 16 6 11 51:49 2 54
5 SpVgg Landshut, Deutschland SpVgg Landshut 33 15 7 11 55:50 5 52
6 Jahn Regensburg II, Deutschland Jahn Regensburg II 33 14 8 11 53:44 9 50
7 FC Unterföhring, Deutschland FC Unterföhring 33 12 13 8 49:43 6 49
8 SpVgg Hankofen-Hailing, Deutschland SpVgg Hankofen-Hailing 34 14 7 13 45:50 -5 49
9 SB DJK Rosenheim, Deutschland SB DJK Rosenheim 33 13 8 12 48:40 8 47
10 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 33 13 7 13 36:36 0 46
11 TSV Schwabmünchen, Deutschland TSV Schwabmünchen 34 12 9 13 35:35 0 45
12 FC Affing, Deutschland FC Affing 33 14 3 16 55:58 -3 45
13 1. FC Sonthofen, Deutschland 1. FC Sonthofen 33 12 9 12 46:50 -4 45
14 BCF Wolfratshausen, Deutschland BCF Wolfratshausen 33 11 8 14 43:44 -1 41
15 TSV Gersthofen, Deutschland TSV Gersthofen 34 9 8 17 41:70 -29 35
16 TSV Aindling, Deutschland TSV Aindling 33 10 5 18 34:58 -24 35
17 SpVgg GW Deggendorf, Deutschland SpVgg GW Deggendorf 33 9 8 16 36:52 -16 35
18 SC Fürstenfeldbruck, Deutschland SC Fürstenfeldbruck 33 7 10 16 31:47 -16 31
19 TSV Kottern-St. Mang, Deutschland TSV Kottern-St. Mang 33 7 9 17 39:56 -17 30
  Aufstieg
  Playoffs
  Relegation
  Abstieg

# Weil Wacker Burghausen für seine zweite Mannschaft keine Regionalliga-Lizenz beantragt hat, rückt Aich in die Aufstiegsplayoffs auf.