05.03.2004 19:00 TSV 1860 München II - Würzburger FV 3:0
06.03.2004 15:00 TSV Großbardorf - FC Ismaning 3:2
15:00 SpVgg Unterhaching II - SpVgg Bayreuth 3:1
07.03.2004 15:00 FC Bayern Hof - Jahn Regensburg II 1:1
07.04.2004 18:00 SpVgg Ansbach - SpVgg Greuther Fürth II 0:4
20.04.2004 19:00 SC 04 Schwabach - 1. FC Nürnberg II 1:2
19:00 SpVgg Landshut - SC Fürstenfeldbruck 0:1
21.04.2004 18:00 1. FC Passau - SpVgg Weiden 3:3
19:00 TSV Aindling - FC Memmingen 0:3
# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 22 13 4 5 41:25 16 43
2 TSV 1860 München II, Deutschland TSV 1860 München II 22 13 3 6 43:30 13 42
3 SpVgg Unterhaching II, Deutschland SpVgg Unterhaching II 22 12 5 5 39:17 22 41
4 Jahn Regensburg II, Deutschland Jahn Regensburg II 22 11 9 2 39:19 20 39
5 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 22 11 5 6 47:25 22 38
6 SC Fürstenfeldbruck, Deutschland SC Fürstenfeldbruck 22 10 6 6 30:27 3 36
7 SC 04 Schwabach, Deutschland SC 04 Schwabach 22 9 7 6 36:31 5 34
8 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 22 9 6 7 31:24 7 33
9 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 22 9 5 8 30:24 6 32
10 FC Ismaning, Deutschland FC Ismaning 22 8 6 8 35:33 2 30
11 SpVgg Weiden, Deutschland SpVgg Weiden 22 7 8 7 31:28 3 29
12 TSV Großbardorf, Deutschland TSV Großbardorf 22 8 4 10 40:44 -4 28
13 SpVgg Ansbach, Deutschland SpVgg Ansbach 22 6 6 10 28:35 -7 24
14 TSV Aindling, Deutschland TSV Aindling 22 5 9 8 23:36 -13 21
15 1. FC Passau, Deutschland 1. FC Passau 22 4 8 10 24:42 -18 20
16 Würzburger FV, Deutschland Würzburger FV 22 4 7 11 27:49 -22 19
17 FC Bayern Hof, Deutschland FC Bayern Hof 22 1 9 12 20:55 -35 12
18 SpVgg Landshut, Deutschland SpVgg Landshut 22 2 5 15 25:52 -27 11

# Das Spiel Weiden - Regensburg (1. Spieltag) wurde für Regensburg mit 0:2 gewertet.

# Das Spiel Ansbach - Aindling (33. Spieltag) wurde für beide mit 0:2 gewertet.