# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 Bischofswerdaer FV, Deutschland Bischofswerdaer FV 7 5 1 1 14:5 9 16
2 FC Einheit Rudolstadt, Deutschland FC Einheit Rudolstadt 7 4 3 0 14:6 8 15
3 Inter Leipzig, Deutschland Inter Leipzig 7 5 0 2 14:9 5 15
4 Union Sandersdorf, Deutschland Union Sandersdorf 6 4 1 1 14:5 9 13
5 1. FC Lok Leipzig, Deutschland 1. FC Lok Leipzig 5 4 1 0 12:4 8 13
6 Energie Cottbus II, Deutschland Energie Cottbus II 7 4 0 3 12:11 1 12
7 FC Carl Zeiss Jena II, Deutschland FC Carl Zeiss Jena II 6 3 1 2 17:10 7 10
8 VfL Halle 96, Deutschland VfL Halle 96 6 3 1 2 14:7 7 10
9 SSV Markranstädt, Deutschland SSV Markranstädt 6 2 1 3 11:14 -3 7
10 SV SCHOTT Jena, Deutschland SV SCHOTT Jena 8 2 1 5 9:18 -9 7
11 Rot-Weiß Erfurt II, Deutschland Rot-Weiß Erfurt II 6 1 2 3 7:12 -5 5
12 FSV Barleben, Deutschland FSV Barleben 6 1 1 4 7:14 -7 4
13 Askania Bernburg, Deutschland Askania Bernburg 7 0 3 4 6:15 -9 3
14 BSG Wismut Gera, Deutschland BSG Wismut Gera 7 0 2 5 9:22 -13 2
15 VFC Plauen, Deutschland VFC Plauen 6 0 2 4 4:23 -19 2
16 FC Eisenach, Deutschland FC Eisenach 7 0 1 6 5:22 -17 1
  Aufstieg
  Abstieg

# Rot-Weiß Erfurt II und Energie Cottbus II wurden zum Saisonende zurückgezogen. Dadurch verringerte sich die Zahl der sportlichen Absteiger.

# Der FC Eisenach beantragte für die Saison 2016/2017 keine Oberligalizenz