# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 1. FC Lok Leipzig, Deutschland 1. FC Lok Leipzig 13 11 2 0 37:7 30 35
2 Bischofswerdaer FV, Deutschland Bischofswerdaer FV 13 8 3 2 27:12 15 27
3 Inter Leipzig, Deutschland Inter Leipzig 13 8 2 3 33:17 16 26
4 FC Einheit Rudolstadt, Deutschland FC Einheit Rudolstadt 13 6 5 2 20:14 6 23
5 Energie Cottbus II, Deutschland Energie Cottbus II 13 7 1 5 32:27 5 22
6 FC Carl Zeiss Jena II, Deutschland FC Carl Zeiss Jena II 13 6 2 5 33:21 12 20
7 SSV Markranstädt, Deutschland SSV Markranstädt 13 6 2 5 24:23 1 20
8 VfL Halle 96, Deutschland VfL Halle 96 13 5 3 5 24:19 5 18
9 Union Sandersdorf, Deutschland Union Sandersdorf 13 5 3 5 25:22 3 18
10 VFC Plauen, Deutschland VFC Plauen 13 5 3 5 21:30 -9 18
11 FSV Barleben, Deutschland FSV Barleben 13 5 2 6 19:22 -3 17
12 Askania Bernburg, Deutschland Askania Bernburg 13 3 4 6 16:21 -5 13
13 SV SCHOTT Jena, Deutschland SV SCHOTT Jena 13 4 1 8 16:31 -15 13
14 Rot-Weiß Erfurt II, Deutschland Rot-Weiß Erfurt II 13 2 4 7 14:25 -11 10
15 BSG Wismut Gera, Deutschland BSG Wismut Gera 13 1 3 9 15:34 -19 6
16 FC Eisenach, Deutschland FC Eisenach 13 1 2 10 10:41 -31 5
  Aufstieg
  Abstieg

# Rot-Weiß Erfurt II und Energie Cottbus II wurden zum Saisonende zurückgezogen. Dadurch verringerte sich die Zahl der sportlichen Absteiger.

# Der FC Eisenach beantragte für die Saison 2016/2017 keine Oberligalizenz