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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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1. FC Lok Leipzig | 11 | 6 | 5 | 0 | 20:6 | 14 | 23 |
| 2 |
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Bischofswerdaer FV | 12 | 6 | 4 | 2 | 19:10 | 9 | 22 |
| 3 |
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Inter Leipzig | 11 | 7 | 1 | 3 | 19:11 | 8 | 22 |
| 4 |
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FC Einheit Rudolstadt | 11 | 5 | 4 | 2 | 18:10 | 8 | 19 |
| 5 |
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Union Sandersdorf | 11 | 6 | 1 | 4 | 19:15 | 4 | 19 |
| 6 |
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FC Carl Zeiss Jena II | 10 | 4 | 3 | 3 | 23:18 | 5 | 15 |
| 7 |
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Energie Cottbus II | 11 | 5 | 0 | 6 | 15:24 | -9 | 15 |
| 8 |
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SSV Markranstädt | 10 | 4 | 2 | 4 | 16:20 | -4 | 14 |
| 9 |
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Askania Bernburg | 12 | 3 | 5 | 4 | 14:19 | -5 | 14 |
| 10 |
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VfL Halle 96 | 10 | 4 | 1 | 5 | 26:19 | 7 | 13 |
| 11 |
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FSV Barleben | 10 | 3 | 2 | 5 | 17:19 | -2 | 11 |
| 12 |
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Rot-Weiß Erfurt II | 11 | 2 | 3 | 6 | 14:30 | -16 | 9 |
| 13 |
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SV SCHOTT Jena | 13 | 2 | 1 | 10 | 12:31 | -19 | 7 |
| 14 |
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BSG Wismut Gera | 11 | 0 | 2 | 9 | 10:33 | -23 | 2 |
| 15 |
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VFC Plauen | 11 | 0 | 2 | 9 | 7:41 | -34 | 2 |
| 16 |
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FC Eisenach | 11 | 0 | 1 | 10 | 7:43 | -36 | 1 |
| Aufstieg | |
| Abstieg |
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# Rot-Weiß Erfurt II und Energie Cottbus II wurden zum Saisonende zurückgezogen. Dadurch verringerte sich die Zahl der sportlichen Absteiger. # Der FC Eisenach beantragte für die Saison 2016/2017 keine Oberligalizenz |
