# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 23 10 10 3 28:14 14 40 1.74
2 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 24 11 8 5 24:15 9 41 1.71
3 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 23 11 6 6 26:20 6 39 1.70
4 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 23 10 7 6 20:10 10 37 1.61
5 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 23 10 7 6 25:19 6 37 1.61
6 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 24 10 8 6 23:12 11 38 1.58
7 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 24 10 7 7 17:16 1 37 1.54
8 TSV Aubstadt, Deutschland TSV Aubstadt 23 9 7 7 22:22 0 34 1.48
9 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 23 8 9 6 19:17 2 33 1.43
10 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 22 8 5 9 19:26 -7 29 1.32
11 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 24 10 1 13 24:26 -2 31 1.29
12 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 23 6 10 7 19:18 1 28 1.22
13 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 21 5 9 7 12:15 -3 24 1.14
14 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 24 8 2 14 20:32 -12 26 1.08
15 TSV 1896 Rain, Deutschland TSV 1896 Rain 23 5 8 10 17:22 -5 23 1.00
16 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 23 6 5 12 17:27 -10 23 1.00
17 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 20 1 5 14 8:29 -21 8 0.40
18 Türkgücü München, Deutschland Türkgücü München 0 0 0 0 0:0 0 0
  Playoffs
  Playoffs
  Abstieg

# Im Zuge der Unterbrechung durch die Corona-Epidemie und der späteren Fortführung der Liga hatte der Bayerische Fußball-Verband beschlossen, alle Spiele von Türkgücü München (Aufsteiger in die 3. Liga 2020/2021) aus der Wertung der gesamten Spielzeit zu nehmen.

# Wegen der Coronavirus-Pandemie konnte die Saison nicht zu Ende gespielt werden. Stattdessen wurden Playoffs zwischen Bayreuth, Schweinfurt und Aschaffenburg angesetzt, um den für die Aufstiegsrunde zur 3. Liga berechtigten Verein zu ermittteln.