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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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1. FC Nürnberg II | 10 | 6 | 2 | 2 | 16:7 | 9 | 20 |
| 2 |
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VfR Aalen | 9 | 6 | 2 | 1 | 9:2 | 7 | 20 |
| 3 |
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SC Freiburg II | 9 | 5 | 3 | 1 | 17:6 | 11 | 18 |
| 4 |
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Hessen Kassel | 9 | 3 | 5 | 1 | 15:14 | 1 | 14 |
| 5 |
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SpVgg Weiden | 10 | 4 | 0 | 6 | 19:26 | -7 | 12 |
| 6 |
|
SSV Ulm 1846 | 10 | 3 | 2 | 5 | 16:19 | -3 | 11 |
| 7 |
|
SSV Reutlingen | 9 | 3 | 2 | 4 | 10:16 | -6 | 11 |
| 8 |
|
Stuttgarter Kickers | 10 | 2 | 4 | 4 | 11:14 | -3 | 10 |
| 9 |
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SpVgg Greuther Fürth II | 10 | 3 | 1 | 6 | 13:19 | -6 | 10 |
| 10 |
|
SG Sonnenhof Großaspach | 10 | 2 | 3 | 5 | 8:12 | -4 | 9 |
| 11 |
|
Eintracht Frankfurt II | 9 | 2 | 2 | 5 | 12:14 | -2 | 8 |
| 12 |
|
SC Pfullendorf | 9 | 1 | 4 | 4 | 7:12 | -5 | 7 |
| 13 |
|
Bayern Alzenau | 9 | 2 | 1 | 6 | 7:16 | -9 | 7 |
| 14 |
|
TSV 1860 München II | 10 | 1 | 3 | 6 | 9:13 | -4 | 6 |
| 15 |
|
Karlsruher SC II | 9 | 1 | 3 | 5 | 9:17 | -8 | 6 |
| 16 |
|
SV Darmstadt 98 | 10 | 0 | 5 | 5 | 9:17 | -8 | 5 |
| 17 |
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1. FC Eintracht Bamberg | 9 | 0 | 4 | 5 | 12:21 | -9 | 4 |
| 18 |
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SV Wehen Wiesbaden II | 10 | 1 | 1 | 8 | 9:25 | -16 | 4 |
| Aufstieg | |
| Abstieg |
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# Der SSV Reutlingen und Eintracht Bamberg meldeten während der Saison 2009/2010 Insolvenz an und stehen somit bereits als Absteiger fest. |
