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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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VfR Aalen | 11 | 7 | 3 | 1 | 20:8 | 12 | 24 |
| 2 |
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SC Pfullendorf | 10 | 7 | 2 | 1 | 22:9 | 13 | 23 |
| 3 |
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SSV Ulm 1846 | 9 | 6 | 3 | 0 | 17:4 | 13 | 21 |
| 4 |
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Hessen Kassel | 11 | 5 | 5 | 1 | 18:9 | 9 | 20 |
| 5 |
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Stuttgarter Kickers | 10 | 5 | 5 | 0 | 13:5 | 8 | 20 |
| 6 |
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1. FC Nürnberg II | 10 | 5 | 4 | 1 | 14:6 | 8 | 19 |
| 7 |
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SG Sonnenhof Großaspach | 9 | 5 | 3 | 1 | 21:10 | 11 | 18 |
| 8 |
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TSV 1860 München II | 9 | 5 | 3 | 1 | 17:9 | 8 | 18 |
| 9 |
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Eintracht Frankfurt II | 11 | 4 | 5 | 2 | 19:10 | 9 | 17 |
| 10 |
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Karlsruher SC II | 10 | 5 | 2 | 3 | 16:14 | 2 | 17 |
| 11 |
|
SC Freiburg II | 10 | 4 | 4 | 2 | 17:13 | 4 | 16 |
| 12 |
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SSV Reutlingen | 11 | 4 | 4 | 3 | 16:12 | 4 | 16 |
| 13 |
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SpVgg Greuther Fürth II | 9 | 5 | 1 | 3 | 16:14 | 2 | 16 |
| 14 |
|
SpVgg Weiden | 9 | 5 | 1 | 3 | 16:16 | 0 | 16 |
| 15 |
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SV Darmstadt 98 | 9 | 3 | 1 | 5 | 14:14 | 0 | 10 |
| 16 |
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1. FC Eintracht Bamberg | 11 | 3 | 1 | 7 | 11:27 | -16 | 10 |
| 17 |
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SV Wehen Wiesbaden II | 10 | 2 | 3 | 5 | 8:14 | -6 | 9 |
| 18 |
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Bayern Alzenau | 11 | 1 | 1 | 9 | 7:25 | -18 | 4 |
| Aufstieg | |
| Abstieg |
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# Der SSV Reutlingen und Eintracht Bamberg meldeten während der Saison 2009/2010 Insolvenz an und stehen somit bereits als Absteiger fest. |
