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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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VfR Aalen | 15 | 10 | 4 | 1 | 27:9 | 18 | 34 |
| 2 |
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SC Pfullendorf | 14 | 9 | 4 | 1 | 26:11 | 15 | 31 |
| 3 |
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SpVgg Weiden | 14 | 10 | 1 | 3 | 25:19 | 6 | 31 |
| 4 |
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Hessen Kassel | 15 | 8 | 6 | 1 | 29:12 | 17 | 30 |
| 5 |
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1. FC Nürnberg II | 14 | 8 | 5 | 1 | 24:7 | 17 | 29 |
| 6 |
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SSV Ulm 1846 | 14 | 8 | 4 | 2 | 23:12 | 11 | 28 |
| 7 |
|
TSV 1860 München II | 14 | 7 | 6 | 1 | 24:14 | 10 | 27 |
| 8 |
|
Karlsruher SC II | 14 | 8 | 3 | 3 | 24:16 | 8 | 27 |
| 9 |
|
Stuttgarter Kickers | 14 | 6 | 8 | 0 | 18:8 | 10 | 26 |
| 10 |
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SpVgg Greuther Fürth II | 13 | 8 | 2 | 3 | 23:17 | 6 | 26 |
| 11 |
|
SC Freiburg II | 14 | 7 | 4 | 3 | 26:16 | 10 | 25 |
| 12 |
|
SSV Reutlingen | 14 | 7 | 4 | 3 | 24:14 | 10 | 25 |
| 13 |
|
Eintracht Frankfurt II | 14 | 6 | 6 | 2 | 27:13 | 14 | 24 |
| 14 |
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SG Sonnenhof Großaspach | 13 | 6 | 4 | 3 | 27:16 | 11 | 22 |
| 15 |
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SV Darmstadt 98 | 14 | 6 | 1 | 7 | 20:19 | 1 | 19 |
| 16 |
|
SV Wehen Wiesbaden II | 14 | 3 | 5 | 6 | 11:17 | -6 | 14 |
| 17 |
|
1. FC Eintracht Bamberg | 14 | 4 | 1 | 9 | 14:32 | -18 | 13 |
| 18 |
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Bayern Alzenau | 14 | 2 | 2 | 10 | 10:28 | -18 | 8 |
| Aufstieg | |
| Abstieg |
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# Der SSV Reutlingen und Eintracht Bamberg meldeten während der Saison 2009/2010 Insolvenz an und stehen somit bereits als Absteiger fest. |
