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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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VfR Aalen | 10 | 7 | 2 | 1 | 12:2 | 10 | 23 |
| 2 |
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1. FC Nürnberg II | 11 | 6 | 2 | 3 | 16:8 | 8 | 20 |
| 3 |
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SC Freiburg II | 10 | 5 | 4 | 1 | 18:7 | 11 | 19 |
| 4 |
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Hessen Kassel | 10 | 4 | 5 | 1 | 17:15 | 2 | 17 |
| 5 |
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SpVgg Greuther Fürth II | 11 | 4 | 1 | 6 | 17:21 | -4 | 13 |
| 6 |
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SSV Ulm 1846 | 11 | 3 | 3 | 5 | 17:20 | -3 | 12 |
| 7 |
|
SG Sonnenhof Großaspach | 11 | 3 | 3 | 5 | 10:13 | -3 | 12 |
| 8 |
|
SpVgg Weiden | 11 | 4 | 0 | 7 | 19:28 | -9 | 12 |
| 9 |
|
Stuttgarter Kickers | 11 | 2 | 5 | 4 | 13:16 | -3 | 11 |
| 10 |
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SSV Reutlingen | 10 | 3 | 2 | 5 | 10:18 | -8 | 11 |
| 11 |
|
Karlsruher SC II | 10 | 2 | 3 | 5 | 11:18 | -7 | 9 |
| 12 |
|
Eintracht Frankfurt II | 10 | 2 | 2 | 6 | 13:16 | -3 | 8 |
| 13 |
|
SC Pfullendorf | 10 | 1 | 5 | 4 | 8:13 | -5 | 8 |
| 14 |
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TSV 1860 München II | 11 | 1 | 4 | 6 | 9:13 | -4 | 7 |
| 15 |
|
Bayern Alzenau | 10 | 2 | 1 | 7 | 7:17 | -10 | 7 |
| 16 |
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SV Darmstadt 98 | 11 | 0 | 5 | 6 | 9:20 | -11 | 5 |
| 17 |
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1. FC Eintracht Bamberg | 10 | 0 | 4 | 6 | 14:24 | -10 | 4 |
| 18 |
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SV Wehen Wiesbaden II | 11 | 1 | 1 | 9 | 10:27 | -17 | 4 |
| Aufstieg | |
| Abstieg |
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# Der SSV Reutlingen und Eintracht Bamberg meldeten während der Saison 2009/2010 Insolvenz an und stehen somit bereits als Absteiger fest. |
