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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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SC Pfullendorf | 12 | 9 | 2 | 1 | 25:10 | 15 | 29 |
| 2 |
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VfR Aalen | 12 | 8 | 3 | 1 | 21:8 | 13 | 27 |
| 3 |
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Hessen Kassel | 12 | 6 | 5 | 1 | 23:10 | 13 | 23 |
| 4 |
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Karlsruher SC II | 12 | 7 | 2 | 3 | 22:16 | 6 | 23 |
| 5 |
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1. FC Nürnberg II | 11 | 6 | 4 | 1 | 18:6 | 12 | 22 |
| 6 |
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TSV 1860 München II | 11 | 6 | 4 | 1 | 21:12 | 9 | 22 |
| 7 |
|
SpVgg Weiden | 11 | 7 | 1 | 3 | 20:18 | 2 | 22 |
| 8 |
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SSV Ulm 1846 | 11 | 6 | 3 | 2 | 17:8 | 9 | 21 |
| 9 |
|
Stuttgarter Kickers | 11 | 5 | 6 | 0 | 14:6 | 8 | 21 |
| 10 |
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Eintracht Frankfurt II | 12 | 5 | 5 | 2 | 20:10 | 10 | 20 |
| 11 |
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SpVgg Greuther Fürth II | 11 | 6 | 2 | 3 | 19:15 | 4 | 20 |
| 12 |
|
SG Sonnenhof Großaspach | 11 | 5 | 4 | 2 | 24:14 | 10 | 19 |
| 13 |
|
SSV Reutlingen | 12 | 5 | 4 | 3 | 19:14 | 5 | 19 |
| 14 |
|
SC Freiburg II | 12 | 5 | 4 | 3 | 20:16 | 4 | 19 |
| 15 |
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SV Darmstadt 98 | 11 | 4 | 1 | 6 | 16:17 | -1 | 13 |
| 16 |
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SV Wehen Wiesbaden II | 11 | 3 | 3 | 5 | 10:15 | -5 | 12 |
| 17 |
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1. FC Eintracht Bamberg | 12 | 3 | 1 | 8 | 11:30 | -19 | 10 |
| 18 |
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Bayern Alzenau | 12 | 1 | 2 | 9 | 7:25 | -18 | 5 |
| Aufstieg | |
| Abstieg |
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# Der SSV Reutlingen und Eintracht Bamberg meldeten während der Saison 2009/2010 Insolvenz an und stehen somit bereits als Absteiger fest. |
