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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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VfR Aalen | 14 | 9 | 4 | 1 | 16:4 | 12 | 31 |
| 2 |
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1. FC Nürnberg II | 15 | 7 | 4 | 4 | 22:16 | 6 | 25 |
| 3 |
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SC Freiburg II | 15 | 6 | 5 | 4 | 25:16 | 9 | 23 |
| 4 |
|
Hessen Kassel | 15 | 4 | 7 | 4 | 22:24 | -2 | 19 |
| 5 |
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SSV Ulm 1846 | 15 | 4 | 5 | 6 | 20:25 | -5 | 17 |
| 6 |
|
Eintracht Frankfurt II | 15 | 4 | 4 | 7 | 22:21 | 1 | 16 |
| 7 |
|
Stuttgarter Kickers | 15 | 3 | 6 | 6 | 16:21 | -5 | 15 |
| 8 |
|
SpVgg Greuther Fürth II | 16 | 4 | 2 | 10 | 18:32 | -14 | 14 |
| 9 |
|
Karlsruher SC II | 15 | 3 | 4 | 8 | 15:28 | -13 | 13 |
| 10 |
|
SG Sonnenhof Großaspach | 15 | 3 | 3 | 9 | 12:20 | -8 | 12 |
| 11 |
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1. FC Eintracht Bamberg | 15 | 2 | 6 | 7 | 21:32 | -11 | 12 |
| 12 |
|
SpVgg Weiden | 15 | 4 | 0 | 11 | 24:37 | -13 | 12 |
| 13 |
|
SV Wehen Wiesbaden II | 15 | 3 | 3 | 9 | 17:31 | -14 | 12 |
| 14 |
|
SSV Reutlingen | 15 | 3 | 2 | 10 | 12:30 | -18 | 11 |
| 15 |
|
TSV 1860 München II | 15 | 2 | 4 | 9 | 11:19 | -8 | 10 |
| 16 |
|
SC Pfullendorf | 15 | 1 | 6 | 8 | 12:23 | -11 | 9 |
| 17 |
|
SV Darmstadt 98 | 15 | 0 | 8 | 7 | 11:23 | -12 | 8 |
| 18 |
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Bayern Alzenau | 15 | 2 | 1 | 12 | 7:30 | -23 | 7 |
| Aufstieg | |
| Abstieg |
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# Der SSV Reutlingen und Eintracht Bamberg meldeten während der Saison 2009/2010 Insolvenz an und stehen somit bereits als Absteiger fest. |
