# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 10 4 6 0 12:6 6 18 1.80
2 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 10 5 3 2 9:4 5 18 1.80
3 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 9 4 4 1 10:5 5 16 1.78
4 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 10 4 5 1 9:5 4 17 1.70
5 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 9 5 0 4 11:14 -3 15 1.67
6 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 9 3 4 2 7:7 0 13 1.44
7 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 10 3 5 2 10:3 7 14 1.40
8 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 9 3 3 3 11:12 -1 12 1.33
9 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 9 3 3 3 9:10 -1 12 1.33
10 TSV Aubstadt, Deutschland TSV Aubstadt 10 3 4 3 8:8 0 13 1.30
11 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 10 4 0 6 11:10 1 12 1.20
12 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 9 1 6 2 5:6 -1 9 1.00
13 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 9 2 3 4 4:6 -2 9 1.00
14 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 9 1 5 3 4:6 -2 8 0.89
15 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 9 2 2 5 8:13 -5 8 0.89
16 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 9 1 4 4 5:12 -7 7 0.78
17 TSV 1896 Rain, Deutschland TSV 1896 Rain 10 0 7 3 3:9 -6 7 0.70
18 Türkgücü München, Deutschland Türkgücü München 0 0 0 0 0:0 0 0
  Playoffs
  Playoffs
  Abstieg

# Im Zuge der Unterbrechung durch die Corona-Epidemie und der späteren Fortführung der Liga hatte der Bayerische Fußball-Verband beschlossen, alle Spiele von Türkgücü München (Aufsteiger in die 3. Liga 2020/2021) aus der Wertung der gesamten Spielzeit zu nehmen.

# Wegen der Coronavirus-Pandemie konnte die Saison nicht zu Ende gespielt werden. Stattdessen wurden Playoffs zwischen Bayreuth, Schweinfurt und Aschaffenburg angesetzt, um den für die Aufstiegsrunde zur 3. Liga berechtigten Verein zu ermittteln.