# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 13 7 5 1 14:6 8 26 2.00
2 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 12 6 3 3 11:7 4 21 1.75
3 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 13 5 7 1 13:7 6 22 1.69
4 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 12 5 4 3 14:8 6 19 1.58
5 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 12 6 0 6 13:17 -4 18 1.50
6 TSV Aubstadt, Deutschland TSV Aubstadt 12 4 5 3 11:10 1 17 1.42
7 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 12 4 5 3 8:7 1 17 1.42
8 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 13 6 0 7 15:13 2 18 1.38
9 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 12 3 6 3 11:5 6 15 1.25
10 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 12 4 3 5 7:7 0 15 1.25
11 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 12 4 3 5 14:16 -2 15 1.25
12 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 12 4 3 5 10:13 -3 15 1.25
13 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 12 3 5 4 8:11 -3 14 1.17
14 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 12 4 2 6 10:15 -5 14 1.17
15 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 12 2 6 4 7:9 -2 12 1.00
16 TSV 1896 Rain, Deutschland TSV 1896 Rain 13 2 7 4 7:12 -5 13 1.00
17 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 12 1 4 7 6:16 -10 7 0.58
18 Türkgücü München, Deutschland Türkgücü München 0 0 0 0 0:0 0 0
  Playoffs
  Playoffs
  Abstieg

# Im Zuge der Unterbrechung durch die Corona-Epidemie und der späteren Fortführung der Liga hatte der Bayerische Fußball-Verband beschlossen, alle Spiele von Türkgücü München (Aufsteiger in die 3. Liga 2020/2021) aus der Wertung der gesamten Spielzeit zu nehmen.

# Wegen der Coronavirus-Pandemie konnte die Saison nicht zu Ende gespielt werden. Stattdessen wurden Playoffs zwischen Bayreuth, Schweinfurt und Aschaffenburg angesetzt, um den für die Aufstiegsrunde zur 3. Liga berechtigten Verein zu ermittteln.