# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 13 8 2 3 18:8 10 26 2.00
2 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 14 7 5 2 14:6 8 26 1.86
3 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 13 6 5 2 15:7 8 23 1.77
4 TSV Aubstadt, Deutschland TSV Aubstadt 13 6 4 3 13:8 5 22 1.69
5 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 13 6 3 4 13:12 1 21 1.62
6 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 13 5 3 5 10:8 2 18 1.38
7 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 13 4 5 4 9:7 2 17 1.31
8 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 13 4 5 4 9:8 1 17 1.31
9 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 13 3 7 3 5:7 -2 16 1.23
  Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 13 4 4 5 5:7 -2 16 1.23
11 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 12 3 5 4 5:9 -4 14 1.17
12 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 14 3 7 4 10:15 -5 16 1.14
13 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 12 4 1 7 11:16 -5 13 1.08
14 TSV 1896 Rain, Deutschland TSV 1896 Rain 14 2 8 4 5:8 -3 14 1.00
15 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 13 2 6 5 4:7 -3 12 0.92
16 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 13 2 6 5 7:12 -5 12 0.92
17 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 13 3 2 8 8:16 -8 11 0.85
18 Türkgücü München, Deutschland Türkgücü München 0 0 0 0 0:0 0 0
  Playoffs
  Playoffs
  Abstieg

# Im Zuge der Unterbrechung durch die Corona-Epidemie und der späteren Fortführung der Liga hatte der Bayerische Fußball-Verband beschlossen, alle Spiele von Türkgücü München (Aufsteiger in die 3. Liga 2020/2021) aus der Wertung der gesamten Spielzeit zu nehmen.

# Wegen der Coronavirus-Pandemie konnte die Saison nicht zu Ende gespielt werden. Stattdessen wurden Playoffs zwischen Bayreuth, Schweinfurt und Aschaffenburg angesetzt, um den für die Aufstiegsrunde zur 3. Liga berechtigten Verein zu ermittteln.