# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 16 9 5 2 20:8 12 32 2.00
2 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 16 9 4 3 23:12 11 31 1.94
3 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 16 8 5 3 15:7 8 29 1.81
4 TSV Aubstadt, Deutschland TSV Aubstadt 16 6 7 3 13:8 5 25 1.56
5 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 16 7 3 6 14:9 5 24 1.50
6 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 16 6 6 4 14:11 3 24 1.50
7 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 16 6 5 5 13:13 0 23 1.44
8 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 16 4 8 4 6:8 -2 20 1.25
9 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 16 5 5 6 7:10 -3 20 1.25
10 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 15 4 6 5 6:11 -5 18 1.20
11 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 16 4 7 5 10:9 1 19 1.19
12 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 16 4 7 5 9:9 0 19 1.19
13 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 15 5 2 8 12:17 -5 17 1.13
14 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 16 3 7 6 11:18 -7 16 1.00
15 TSV 1896 Rain, Deutschland TSV 1896 Rain 16 2 9 5 5:10 -5 15 0.94
16 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 16 2 7 7 8:16 -8 13 0.81
17 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 16 3 3 10 8:18 -10 12 0.75
18 Türkgücü München, Deutschland Türkgücü München 0 0 0 0 0:0 0 0
  Playoffs
  Playoffs
  Abstieg

# Im Zuge der Unterbrechung durch die Corona-Epidemie und der späteren Fortführung der Liga hatte der Bayerische Fußball-Verband beschlossen, alle Spiele von Türkgücü München (Aufsteiger in die 3. Liga 2020/2021) aus der Wertung der gesamten Spielzeit zu nehmen.

# Wegen der Coronavirus-Pandemie konnte die Saison nicht zu Ende gespielt werden. Stattdessen wurden Playoffs zwischen Bayreuth, Schweinfurt und Aschaffenburg angesetzt, um den für die Aufstiegsrunde zur 3. Liga berechtigten Verein zu ermittteln.