# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 4 3 1 0 5:0 5 10 2.50
2 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 4 3 0 1 10:2 8 9 2.25
3 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 4 3 0 1 7:5 2 9 2.25
4 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 4 2 1 1 6:4 2 7 1.75
5 TSV Aubstadt, Deutschland TSV Aubstadt 4 2 1 1 4:4 0 7 1.75
6 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 4 1 3 0 4:3 1 6 1.50
  Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 4 1 3 0 4:3 1 6 1.50
8 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 3 1 1 1 2:2 0 4 1.33
9 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 4 0 4 0 3:3 0 4 1.00
10 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 3 1 0 2 3:3 0 3 1.00
11 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 3 1 0 2 3:8 -5 3 1.00
12 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 4 0 3 1 4:5 -1 3 0.75
13 TSV 1896 Rain, Deutschland TSV 1896 Rain 4 0 3 1 1:2 -1 3 0.75
14 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 4 1 0 3 1:4 -3 3 0.75
15 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 3 0 2 1 0:3 -3 2 0.67
16 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 4 0 2 2 3:5 -2 2 0.50
17 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 4 0 2 2 1:5 -4 2 0.50
18 Türkgücü München, Deutschland Türkgücü München 0 0 0 0 0:0 0 0
  Playoffs
  Playoffs
  Abstieg

# Im Zuge der Unterbrechung durch die Corona-Epidemie und der späteren Fortführung der Liga hatte der Bayerische Fußball-Verband beschlossen, alle Spiele von Türkgücü München (Aufsteiger in die 3. Liga 2020/2021) aus der Wertung der gesamten Spielzeit zu nehmen.

# Wegen der Coronavirus-Pandemie konnte die Saison nicht zu Ende gespielt werden. Stattdessen wurden Playoffs zwischen Bayreuth, Schweinfurt und Aschaffenburg angesetzt, um den für die Aufstiegsrunde zur 3. Liga berechtigten Verein zu ermittteln.