# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 9 5 3 1 8:2 6 18 2.00
2 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 9 4 5 0 10:4 6 17 1.89
3 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 8 3 4 1 9:5 4 13 1.63
4 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 9 3 5 1 8:5 3 14 1.56
5 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 8 3 3 2 7:7 0 12 1.50
6 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 8 4 0 4 9:14 -5 12 1.50
7 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 9 3 4 2 10:3 7 13 1.44
8 TSV Aubstadt, Deutschland TSV Aubstadt 9 3 4 2 8:7 1 13 1.44
9 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 8 3 2 3 9:10 -1 11 1.38
10 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 8 2 3 3 4:4 0 9 1.13
11 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 8 2 3 3 7:9 -2 9 1.13
12 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 9 3 0 6 8:9 -1 9 1.00
13 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 8 1 5 2 5:6 -1 8 1.00
14 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 8 1 5 2 4:5 -1 8 1.00
15 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 9 2 2 5 8:13 -5 8 0.89
16 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 8 1 4 3 4:9 -5 7 0.88
17 TSV 1896 Rain, Deutschland TSV 1896 Rain 9 0 6 3 3:9 -6 6 0.67
18 Türkgücü München, Deutschland Türkgücü München 0 0 0 0 0:0 0 0
  Playoffs
  Playoffs
  Abstieg

# Im Zuge der Unterbrechung durch die Corona-Epidemie und der späteren Fortführung der Liga hatte der Bayerische Fußball-Verband beschlossen, alle Spiele von Türkgücü München (Aufsteiger in die 3. Liga 2020/2021) aus der Wertung der gesamten Spielzeit zu nehmen.

# Wegen der Coronavirus-Pandemie konnte die Saison nicht zu Ende gespielt werden. Stattdessen wurden Playoffs zwischen Bayreuth, Schweinfurt und Aschaffenburg angesetzt, um den für die Aufstiegsrunde zur 3. Liga berechtigten Verein zu ermittteln.