# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 VfL Wolfsburg II, Deutschland VfL Wolfsburg II 1 1 0 0 3:0 3 3
2 Hansa Rostock II, Deutschland Hansa Rostock II 1 1 0 0 3:1 2 3
3 Altona 93, Deutschland Altona 93 1 1 0 0 4:3 1 3
4 FC Oberneuland, Deutschland FC Oberneuland 1 1 0 0 2:1 1 3
5 SV Babelsberg 03, Deutschland SV Babelsberg 03 1 1 0 0 1:0 1 3
6 VFC Plauen, Deutschland VFC Plauen 1 0 1 0 2:2 0 1
7 Chemnitzer FC, Deutschland Chemnitzer FC 1 0 1 0 1:1 0 1
  Hamburger SV II, Deutschland Hamburger SV II 1 0 1 0 1:1 0 1
  Sachsen Leipzig, Deutschland Sachsen Leipzig 1 0 1 0 1:1 0 1
  SV Wilhelmshaven, Deutschland SV Wilhelmshaven 1 0 1 0 1:1 0 1
  Türkiyemspor Berlin, Deutschland Türkiyemspor Berlin 1 0 1 0 1:1 0 1
12 Hallescher FC, Deutschland Hallescher FC 1 0 1 0 0:0 0 1
13 1. FC Magdeburg, Deutschland 1. FC Magdeburg 1 0 0 1 0:1 -1 0
  VfB Lübeck, Deutschland VfB Lübeck 1 0 0 1 0:1 -1 0
15 Energie Cottbus II, Deutschland Energie Cottbus II 1 0 0 1 0:2 -2 0
  Hannover 96 II, Deutschland Hannover 96 II 1 0 0 1 0:2 -2 0
  Hertha BSC II, Deutschland Hertha BSC II 1 0 0 1 0:2 -2 0
  Holstein Kiel, Deutschland Holstein Kiel 1 0 0 1 0:2 -2 0
  Aufstieg
  Abstieg

# Sachsen Leipzig hat am 4. März 2009 einen Insolvenzantrag gestellt. Der Verein steht damit als erster Absteiger aus der Regionalliga Nord fest.

# Altona 93 erhält keine Lizenz für die Saison 2009/2010 und steht damit als Absteiger fest.

# Türkiyemspor Berlin hält trotz Rang 15 die Klasse, da Kickes Emden nach dem Lizenzrückzug für die 3. Liga in der Saison 2009/2010 in der Oberliga startet.