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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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Viktoria Köln | 32 | 16 | 12 | 4 | 33:16 | 17 | 60 |
| 2 |
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Bor. Mönchengladbach II | 32 | 15 | 10 | 6 | 30:15 | 15 | 55 |
| 3 |
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Borussia Dortmund II | 32 | 13 | 12 | 7 | 25:14 | 11 | 51 |
| 4 |
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SC Wiedenbrück | 32 | 11 | 15 | 6 | 22:13 | 9 | 48 |
| 5 |
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SG Wattenscheid 09 | 32 | 12 | 11 | 9 | 25:21 | 4 | 47 |
| 6 |
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Rot-Weiss Essen | 32 | 10 | 16 | 6 | 20:12 | 8 | 46 |
| 7 |
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Rot-Weiß Oberhausen | 32 | 10 | 15 | 7 | 25:16 | 9 | 45 |
| 8 |
|
FC Schalke 04 II | 32 | 10 | 15 | 7 | 19:13 | 6 | 45 |
| 9 |
|
Bonner SC | 32 | 12 | 9 | 11 | 27:29 | -2 | 45 |
| 10 |
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Fortuna Düsseldorf II | 32 | 10 | 14 | 8 | 17:17 | 0 | 44 |
| 11 |
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1. FC Köln II | 32 | 11 | 10 | 11 | 19:22 | -3 | 43 |
| 12 |
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SV Rödinghausen | 32 | 9 | 15 | 8 | 23:23 | 0 | 42 |
| 13 |
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Alemannia Aachen | 32 | 9 | 13 | 10 | 16:17 | -1 | 40 |
| 14 |
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Wuppertaler SV | 32 | 8 | 13 | 11 | 15:20 | -5 | 37 |
| 15 |
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SC Verl | 32 | 7 | 13 | 12 | 12:21 | -9 | 34 |
| 16 |
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Sportfreunde Siegen | 32 | 5 | 11 | 16 | 13:30 | -17 | 26 |
| 17 |
|
Rot Weiss Ahlen | 32 | 5 | 7 | 19 | 14:32 | -18 | 22 |
| 18 |
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TSG Sprockhövel | 32 | 2 | 13 | 17 | 10:34 | -24 | 19 |
| Playoffs | |
| Abstieg |
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# Wegen Eröffnung eines Insolvenzverfahrens am 27.März 2017 wurden Alemannia Aachen neun Punkte abgezogen. |
