Bundesliga   Sp. S U N Tore
  Zu Hause 8 1 3 4 4 : 14
  Auswärts 8 1 1 6 5 : 16
  16 2 4 10 9 : 30
DFB-Pokal   Sp. S U N Tore
  Zu Hause 2 0 0 2 1 : 5
  2 0 0 2 1 : 5
Deutsche Meisterschaft   Sp. S U N Tore
  Neutraler Ort 2 1 1 0 3 : 1
  2 1 1 0 3 : 1
Aufstiegsrunde 1. Bundesliga   Sp. S U N Tore
  Zu Hause 1 0 0 1 0 : 4
  Auswärts 1 0 0 1 1 : 6
  2 0 0 2 1 : 10
GESAMT   Sp. S U N Tore
  Zu Hause 11 1 3 7 5 : 23
  Auswärts 9 1 1 7 6 : 22
  Neutraler Ort 2 1 1 0 3 : 1
  22 3 5 14 14 : 46
Bundesliga
2010/2011 33. Spieltag FC St. Pauli - Bayern München 1:8 (0:2)
2010/2011 16. Spieltag Bayern München - FC St. Pauli 3:0 (1:0)
2001/2002 21. Spieltag FC St. Pauli - Bayern München 2:1 (2:0)
2001/2002 4. Spieltag Bayern München - FC St. Pauli 2:0 (2:0)
1996/1997 18. Spieltag Bayern München - FC St. Pauli 3:0 (1:0)
1996/1997 1. Spieltag FC St. Pauli - Bayern München 1:2 (1:2)
1995/1996 27. Spieltag Bayern München - FC St. Pauli 1:1 (0:1)
1995/1996 10. Spieltag FC St. Pauli - Bayern München 0:1 (0:1)
1990/1991 19. Spieltag Bayern München - FC St. Pauli 0:1 (0:1)
1990/1991 2. Spieltag FC St. Pauli - Bayern München 0:0 (0:0)
1989/1990 32. Spieltag Bayern München - FC St. Pauli 1:0 (1:0)
1989/1990 15. Spieltag FC St. Pauli - Bayern München 0:2 (0:0)
1988/1989 30. Spieltag Bayern München - FC St. Pauli 2:1 (1:0)
1988/1989 13. Spieltag FC St. Pauli - Bayern München 0:0 (0:0)
1977/1978 19. Spieltag FC St. Pauli - Bayern München 0:0 (0:0)
1977/1978 2. Spieltag Bayern München - FC St. Pauli 4:2 (3:2)
DFB-Pokal
2006/2007 1. Runde FC St. Pauli - Bayern München 1:2 (1:0, 1:1) n.V.
2005/2006 Halbfinale FC St. Pauli - Bayern München 0:3 (0:1)
Deutsche Meisterschaft
1948/1949 Qual. 2. Runde FC St. Pauli - Bayern München 2:0 (1:0)
1948/1949 Qual. 2. Runde FC St. Pauli - Bayern München 1:1 (0:0, 1:1) n.V.
Aufstiegsrunde 1. Bundesliga
1963/1964 Gruppe 1 Bayern München - FC St. Pauli 6:1 (3:0)
1963/1964 Gruppe 1 FC St. Pauli - Bayern München 0:4 (0:1)

Für Spiele, die im Elfmeterschießen entschieden wurden, geht der Spielstand nach 120 Minuten in diese Wertung ein.