6. Spieltag | 22.09.2016 | FC St. Pauli | - | TSV 1860 München | 2:2 | ||||
7. Spieltag | 26.09.2016 | 1. FC Union Berlin | - | FC St. Pauli | 2:0 | ||||
9. Spieltag | 14.10.2016 | FC St. Pauli | - | Erzgebirge Aue | 1:2 | ||||
10. Spieltag | 22.10.2016 | SV Sandhausen | - | FC St. Pauli | 3:0 | ||||
11. Spieltag | 31.10.2016 | FC St. Pauli | - | 1. FC Nürnberg | 1:1 | ||||
12. Spieltag | 07.11.2016 | Würzburger Kickers | - | FC St. Pauli | 1:0 | ||||
16. Spieltag | 11.12.2016 | SpVgg Greuther Fürth | - | FC St. Pauli | 0:2 |