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| 25.11.2016 | 19:00 | SpVgg Bayreuth | - | FC Memmingen | 0:2 (0:0) | |
| 19:00 | TSV 1860 München II | - | VfR Garching | 2:1 (0:0) | ||
| 26.11.2016 | 14:00 | SV Seligenporten | - | 1. FC Schweinfurt 05 | 2:4 (2:2) | |
| 14:00 | TSV 1860 Rosenheim | - | SpVgg Bayern Hof | 1:0 (0:0) | ||
| 14:00 | TSV Buchbach | - | FC Augsburg II | 2:1 (0:1) | ||
| 14:00 | FV Illertissen | - | 1. FC Nürnberg II | 2:0 (1:0) | ||
| 14:00 | Wacker Burghausen | - | SV Schalding-Heining | 2:1 (1:0) | ||
| 27.11.2016 | 14:00 | SpVgg Unterhaching | - | Bayern München II | 2:1 (1:0) | |
| 14:00 | FC Ingolstadt 04 II | - | SpVgg Greuther Fürth II | 2:0 (0:0) |
| » Tabelle | Heim | Auswärts | Hinrunde | Rückrunde | 1. Halbzeit | 2. Halbzeit |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
SpVgg Unterhaching | 21 | 18 | 3 | 0 | 67:11 | 56 | 57 |
| 2 |
|
Bayern München II | 21 | 10 | 8 | 3 | 34:21 | 13 | 38 |
| 3 |
|
FC Augsburg II | 21 | 9 | 8 | 4 | 44:22 | 22 | 35 |
| 4 |
|
FC Memmingen | 21 | 9 | 6 | 6 | 42:27 | 15 | 33 |
| 5 |
|
1. FC Schweinfurt 05 | 21 | 10 | 3 | 8 | 41:36 | 5 | 33 |
| 6 |
|
1. FC Nürnberg II | 21 | 9 | 5 | 7 | 48:45 | 3 | 32 |
| 7 |
|
Wacker Burghausen | 21 | 9 | 5 | 7 | 31:29 | 2 | 32 |
| 8 |
|
VfR Garching | 21 | 10 | 2 | 9 | 40:44 | -4 | 32 |
| 9 |
|
FV Illertissen | 21 | 9 | 2 | 10 | 27:32 | -5 | 29 |
| 10 |
|
SpVgg Bayreuth | 21 | 8 | 4 | 9 | 36:36 | 0 | 28 |
| 11 |
|
TSV 1860 Rosenheim | 21 | 7 | 4 | 10 | 24:31 | -7 | 25 |
| 12 |
|
FC Ingolstadt 04 II | 21 | 5 | 9 | 7 | 30:38 | -8 | 24 |
| 13 |
|
SpVgg Greuther Fürth II | 21 | 6 | 4 | 11 | 25:32 | -7 | 22 |
| 14 |
|
TSV Buchbach | 21 | 6 | 3 | 12 | 26:46 | -20 | 21 |
| 15 |
|
SV Schalding-Heining | 21 | 4 | 7 | 10 | 29:42 | -13 | 19 |
| 16 |
|
SV Seligenporten | 21 | 5 | 4 | 12 | 28:52 | -24 | 19 |
| 17 |
|
SpVgg Bayern Hof | 21 | 2 | 3 | 16 | 24:55 | -31 | 9 |
| 18 |
|
TSV 1860 München II | 21 | 10 | 6 | 5 | 0:0 | -7 | -27 |
| Playoffs | |
| Relegation | |
| Abstieg |
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# Der TSV 1860 München II steigt gemäß den Statuten des Verbands automatisch in die Bayernliga ab, da die Profimannschaft des Vereins aus der 2. Bundesliga absteigt. Der SV Seligenporten vermeidet damit den direkten Abstieg und spielt in der Relegation, Schalding-Heining ist gerettet. |
