# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 Bayern München II, Deutschland Bayern München II 5 5 0 0 15:3 12 15
2 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 5 4 0 1 12:7 5 12
3 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 4 3 1 0 12:5 7 10
4 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 4 3 1 0 6:2 4 10
5 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 4 3 0 1 7:5 2 9
6 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 4 2 1 1 6:2 4 7
7 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 4 2 1 1 5:3 2 7
8 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 4 1 3 0 7:5 2 6
9 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 4 2 0 2 6:6 0 6
10 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 4 2 0 2 8:9 -1 6
11 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 4 1 2 1 4:3 1 5
12 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 4 1 2 1 6:6 0 5
13 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 4 1 1 2 2:3 -1 4
14 FC Pipinsried, Deutschland FC Pipinsried 4 1 0 3 4:11 -7 3
15 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 4 0 1 3 2:8 -6 1
16 FC Ingolstadt 04 II, Deutschland FC Ingolstadt 04 II 3 0 0 3 3:6 -3 0
17 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 3 0 0 3 1:7 -6 0
18 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 4 0 0 4 0:11 -11 0
  Playoffs
  Relegation
  Abstieg

# Durch den Abstieg der Profimannschaft des FC Ingolstadt 04 in die 3. Liga wurde der FC Ingolstadt 04 II mit 0 Punkten an das Ende der Tabelle gesetzt. Die erspielten Ergebnisse behalten aber ihre Gültigkeit. Das Team lag am Ende der Saison eigentlich mit 45 Punkten auf dem neunten Tabellenplatz.