# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 Bayern München II, Deutschland Bayern München II 8 6 2 0 11:2 9 20
2 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 8 5 2 1 12:3 9 17
3 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 8 3 5 0 6:2 4 14
4 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 8 3 4 1 9:3 6 13
5 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 8 4 1 3 9:6 3 13
6 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 8 4 1 3 9:9 0 13
7 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 8 4 1 3 8:8 0 13
8 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 8 3 3 2 8:5 3 12
9 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 8 3 3 2 7:7 0 12
10 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 8 2 3 3 5:5 0 9
11 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 8 2 3 3 3:5 -2 9
12 FC Pipinsried, Deutschland FC Pipinsried 8 2 3 3 4:9 -5 9
13 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 8 2 2 4 5:6 -1 8
14 FC Ingolstadt 04 II, Deutschland FC Ingolstadt 04 II 8 2 2 4 4:6 -2 8
15 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 8 1 4 3 4:6 -2 7
16 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 8 2 1 5 5:15 -10 7
17 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 8 0 5 3 2:6 -4 5
18 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 8 1 1 6 1:9 -8 4
  Playoffs
  Relegation
  Abstieg

# Durch den Abstieg der Profimannschaft des FC Ingolstadt 04 in die 3. Liga wurde der FC Ingolstadt 04 II mit 0 Punkten an das Ende der Tabelle gesetzt. Die erspielten Ergebnisse behalten aber ihre Gültigkeit. Das Team lag am Ende der Saison eigentlich mit 45 Punkten auf dem neunten Tabellenplatz.