# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SV Babelsberg 03, Deutschland SV Babelsberg 03 7 6 1 0 10:1 9 19
2 Holstein Kiel, Deutschland Holstein Kiel 7 6 0 1 13:5 8 18
3 Hallescher FC, Deutschland Hallescher FC 7 4 3 0 8:4 4 15
4 Hamburger SV II, Deutschland Hamburger SV II 7 3 3 1 11:6 5 12
5 1. FC Magdeburg, Deutschland 1. FC Magdeburg 7 4 0 3 8:6 2 12
6 SV Wilhelmshaven, Deutschland SV Wilhelmshaven 7 3 3 1 11:10 1 12
7 VFC Plauen, Deutschland VFC Plauen 7 2 4 1 10:8 2 10
8 Hannover 96 II, Deutschland Hannover 96 II 7 3 1 3 10:9 1 10
9 FC Oberneuland, Deutschland FC Oberneuland 7 3 1 3 6:6 0 10
10 Hansa Rostock II, Deutschland Hansa Rostock II 7 3 0 4 9:14 -5 9
11 VfL Wolfsburg II, Deutschland VfL Wolfsburg II 7 2 2 3 9:7 2 8
12 VfB Lübeck, Deutschland VfB Lübeck 7 2 2 3 8:6 2 8
13 Altona 93, Deutschland Altona 93 7 2 1 4 10:16 -6 7
14 Hertha BSC II, Deutschland Hertha BSC II 7 2 1 4 6:14 -8 7
15 Sachsen Leipzig, Deutschland Sachsen Leipzig 7 1 3 3 3:8 -5 6
16 Chemnitzer FC, Deutschland Chemnitzer FC 7 1 2 4 11:11 0 5
17 Türkiyemspor Berlin, Deutschland Türkiyemspor Berlin 7 1 2 4 6:11 -5 5
18 Energie Cottbus II, Deutschland Energie Cottbus II 7 0 1 6 3:10 -7 1
  Aufstieg
  Abstieg

# Sachsen Leipzig hat am 4. März 2009 einen Insolvenzantrag gestellt. Der Verein steht damit als erster Absteiger aus der Regionalliga Nord fest.

# Altona 93 erhält keine Lizenz für die Saison 2009/2010 und steht damit als Absteiger fest.

# Türkiyemspor Berlin hält trotz Rang 15 die Klasse, da Kickes Emden nach dem Lizenzrückzug für die 3. Liga in der Saison 2009/2010 in der Oberliga startet.