# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 Eintracht Frankfurt II, Deutschland Eintracht Frankfurt II 19 12 5 2 34:13 21 41
2 Hessen Kassel, Deutschland Hessen Kassel 19 12 3 4 39:18 21 39
3 SV Wehen Wiesbaden II, Deutschland SV Wehen Wiesbaden II 19 11 2 6 25:14 11 35
4 Waldhof Mannheim, Deutschland Waldhof Mannheim 19 11 1 7 34:23 11 34
5 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 19 9 5 5 38:20 18 32
6 1. FC Heidenheim 1846, Deutschland 1. FC Heidenheim 1846 19 9 5 5 31:25 6 32
7 SSV Ulm 1846, Deutschland SSV Ulm 1846 19 7 10 2 28:17 11 31
8 SC Pfullendorf, Deutschland SC Pfullendorf 19 9 4 6 28:25 3 31
9 TSV 1860 München II, Deutschland TSV 1860 München II 19 7 5 7 26:26 0 26
10 1. FC Eintracht Bamberg, Deutschland 1. FC Eintracht Bamberg 19 7 5 7 34:38 -4 26
11 SV Darmstadt 98, Deutschland SV Darmstadt 98 19 6 7 6 27:24 3 25
12 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 19 6 5 8 21:21 0 23
13 Karlsruher SC II, Deutschland Karlsruher SC II 19 6 4 9 21:29 -8 22
14 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 19 4 8 7 19:24 -5 20
15 SSV Reutlingen, Deutschland SSV Reutlingen 19 4 5 10 17:33 -16 17
16 TSV Großbardorf, Deutschland TSV Großbardorf 19 3 5 11 22:45 -23 14
17 SC Freiburg II, Deutschland SC Freiburg II 19 3 4 12 17:39 -22 13
18 SpVgg Unterhaching II, Deutschland SpVgg Unterhaching II 19 2 3 14 19:46 -27 9
  Aufstieg
  Abstieg

# Das Spiel Unterhaching II - 1860 II (25. Spieltag) wurde wegen des Einsatzes eines nicht spielberechtigten Spielers mit 0:2 gewertet.

# Viktoria Aschaffenburg hat aus finanziellen Gründen keine Lizenz für die Saison 2009/2010 beantragt und steht damit als Absteiger fest.