4. Spieltag 02.08.2016 SV Seligenporten - SV Schalding-Heining 1:6
5. Spieltag 05.08.2016 1. FC Schweinfurt 05 - SV Seligenporten 1:0
6. Spieltag 13.08.2016 SV Seligenporten - 1. FC Nürnberg II 1:4
7. Spieltag 19.08.2016 FV Illertissen - SV Seligenporten 0:1
8. Spieltag 27.08.2016 SV Seligenporten - SpVgg Bayern Hof 5:1
9. Spieltag 02.09.2016 SV Seligenporten - Wacker Burghausen 4:3 gelbe Karte
10. Spieltag 10.09.2016 TSV Buchbach - SV Seligenporten 0:0
11. Spieltag 16.09.2016 SV Seligenporten - SpVgg Unterhaching 0:0 gelbe Karte
12. Spieltag 24.09.2016 FC Ingolstadt 04 II - SV Seligenporten 2:1
13. Spieltag 01.10.2016 SV Seligenporten - SpVgg Bayreuth 4:1 gelbe Karte
14. Spieltag 08.10.2016 TSV 1860 München II - SV Seligenporten 1:1
15. Spieltag 15.10.2016 SV Seligenporten - TSV 1860 Rosenheim 1:1
17. Spieltag 29.10.2016 SV Seligenporten - FC Memmingen 2:4
18. Spieltag 05.11.2016 SV Seligenporten - SpVgg Greuther Fürth II 3:1 gelbe Karte
21. Spieltag 26.11.2016 SV Seligenporten - 1. FC Schweinfurt 05 2:4 gelbe Karte
23. Spieltag 10.03.2017 SV Seligenporten - FV Illertissen 0:1 gelbe Karte
24. Spieltag 18.03.2017 Wacker Burghausen - SV Seligenporten 3:3
25. Spieltag 25.03.2017 SpVgg Bayern Hof - SV Seligenporten 1:2
26. Spieltag 31.03.2017 SV Seligenporten - TSV Buchbach 0:2 gelbe Karte
20. Spieltag 04.04.2017 SV Schalding-Heining - SV Seligenporten 1:0
27. Spieltag 08.04.2017 SpVgg Unterhaching - SV Seligenporten 1:1 gelbe Karte
28. Spieltag 13.04.2017 SV Seligenporten - FC Ingolstadt 04 II 2:2 gelbe Karte
29. Spieltag 17.04.2017 SpVgg Bayreuth - SV Seligenporten 3:1
30. Spieltag 21.04.2017 SV Seligenporten - FC Augsburg II 0:4
31. Spieltag 29.04.2017 SV Seligenporten - TSV 1860 München II 1:2 gelbe Karte
33. Spieltag 13.05.2017 SV Seligenporten - VfR Garching 0:0 gelbe Karte
34. Spieltag 20.05.2017 FC Memmingen - SV Seligenporten 1:3