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| 31.03.2017 | 18:30 | SV Seligenporten | - | TSV Buchbach | 0:2 (0:0) | |
| 19:00 | Bayern München II | - | VfR Garching | 2:1 (1:0) | ||
| 01.04.2017 | 14:00 | 1. FC Nürnberg II | - | FC Ingolstadt 04 II | 0:6 (0:3) | |
| 14:00 | SpVgg Greuther Fürth II | - | FC Memmingen | 0:1 (0:1) | ||
| 14:00 | FC Augsburg II | - | TSV 1860 Rosenheim | 4:1 (3:0) | ||
| 14:00 | SV Schalding-Heining | - | TSV 1860 München II | 1:3 (1:0) | ||
| 14:00 | SpVgg Bayern Hof | - | Wacker Burghausen | 0:1 (0:1) | ||
| 14:00 | FV Illertissen | - | SpVgg Unterhaching | 3:3 (2:1) | ||
| 03.04.2017 | 20:15 | 1. FC Schweinfurt 05 | - | SpVgg Bayreuth | 2:0 (0:0) |
| » Tabelle | Heim | Auswärts | Hinrunde | Rückrunde | 1. Halbzeit | 2. Halbzeit |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
SpVgg Unterhaching | 26 | 19 | 6 | 1 | 72:16 | 56 | 63 |
| 2 |
|
FC Memmingen | 26 | 13 | 6 | 7 | 50:29 | 21 | 45 |
| 3 |
|
1. FC Schweinfurt 05 | 26 | 13 | 4 | 9 | 49:40 | 9 | 43 |
| 4 |
|
Bayern München II | 26 | 11 | 9 | 6 | 38:28 | 10 | 42 |
| 5 |
|
Wacker Burghausen | 26 | 12 | 6 | 8 | 40:35 | 5 | 42 |
| 6 |
|
FC Augsburg II | 26 | 11 | 8 | 7 | 50:27 | 23 | 41 |
| 7 |
|
FV Illertissen | 26 | 12 | 4 | 10 | 33:35 | -2 | 40 |
| 8 |
|
1. FC Nürnberg II | 26 | 10 | 7 | 9 | 53:57 | -4 | 37 |
| 9 |
|
SpVgg Bayreuth | 26 | 10 | 6 | 10 | 41:40 | 1 | 36 |
| 10 |
|
VfR Garching | 26 | 11 | 3 | 12 | 44:51 | -7 | 36 |
| 11 |
|
TSV 1860 Rosenheim | 26 | 9 | 5 | 12 | 31:41 | -10 | 32 |
| 12 |
|
FC Ingolstadt 04 II | 26 | 7 | 9 | 10 | 37:44 | -7 | 30 |
| 13 |
|
TSV Buchbach | 26 | 7 | 7 | 12 | 32:50 | -18 | 28 |
| 14 |
|
SpVgg Greuther Fürth II | 26 | 6 | 7 | 13 | 29:40 | -11 | 25 |
| 15 |
|
SV Schalding-Heining | 26 | 5 | 9 | 12 | 32:46 | -14 | 24 |
| 16 |
|
SV Seligenporten | 26 | 6 | 5 | 15 | 33:60 | -27 | 23 |
| 17 |
|
SpVgg Bayern Hof | 26 | 2 | 3 | 21 | 26:63 | -37 | 9 |
| 18 |
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TSV 1860 München II | 26 | 15 | 6 | 5 | 0:0 | 2 | -12 |
| Playoffs | |
| Relegation | |
| Abstieg |
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# Der TSV 1860 München II steigt gemäß den Statuten des Verbands automatisch in die Bayernliga ab, da die Profimannschaft des Vereins aus der 2. Bundesliga absteigt. Der SV Seligenporten vermeidet damit den direkten Abstieg und spielt in der Relegation, Schalding-Heining ist gerettet. |
