# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 Bayern München II, Deutschland Bayern München II 7 6 0 1 20:6 14 18
2 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 6 4 2 0 10:4 6 14
3 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 6 4 1 1 10:5 5 13
4 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 8 4 1 3 14:16 -2 13
5 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 7 2 5 0 12:8 4 11
6 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 6 3 2 1 9:5 4 11
7 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 7 3 2 2 13:12 1 11
8 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 7 3 1 3 11:10 1 10
9 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 7 2 2 3 8:7 1 8
10 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 6 2 2 2 6:5 1 8
11 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 7 1 5 1 11:11 0 8
12 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 7 2 2 3 9:11 -2 8
13 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 7 2 1 4 10:16 -6 7
14 FC Pipinsried, Deutschland FC Pipinsried 6 2 0 4 6:14 -8 6
15 FC Ingolstadt 04 II, Deutschland FC Ingolstadt 04 II 5 1 1 3 6:8 -2 4
16 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 7 1 0 6 1:17 -16 3
17 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 6 0 2 4 4:12 -8 2
18 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 5 0 1 4 4:11 -7 1
  Playoffs
  Relegation
  Abstieg

# Durch den Abstieg der Profimannschaft des FC Ingolstadt 04 in die 3. Liga wurde der FC Ingolstadt 04 II mit 0 Punkten an das Ende der Tabelle gesetzt. Die erspielten Ergebnisse behalten aber ihre Gültigkeit. Das Team lag am Ende der Saison eigentlich mit 45 Punkten auf dem neunten Tabellenplatz.