# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 Bayern München II, Deutschland Bayern München II 8 7 0 1 24:6 18 21
2 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 7 5 1 1 11:5 6 16
3 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 7 4 3 0 10:4 6 15
4 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 8 4 1 3 14:16 -2 13
5 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 7 2 5 0 12:8 4 11
6 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 7 3 2 2 13:12 1 11
7 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 7 3 2 2 9:8 1 11
8 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 7 3 1 3 11:10 1 10
9 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 7 2 3 2 6:5 1 9
10 FC Pipinsried, Deutschland FC Pipinsried 7 3 0 4 8:14 -6 9
11 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 7 2 2 3 8:7 1 8
12 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 7 1 5 1 11:11 0 8
13 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 7 2 2 3 9:11 -2 8
14 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 7 2 1 4 10:16 -6 7
15 FC Ingolstadt 04 II, Deutschland FC Ingolstadt 04 II 6 1 2 3 7:9 -2 5
16 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 7 1 2 4 5:12 -7 5
17 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 6 1 1 4 8:12 -4 4
18 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 7 1 0 6 1:17 -16 3
  Playoffs
  Relegation
  Abstieg

# Durch den Abstieg der Profimannschaft des FC Ingolstadt 04 in die 3. Liga wurde der FC Ingolstadt 04 II mit 0 Punkten an das Ende der Tabelle gesetzt. Die erspielten Ergebnisse behalten aber ihre Gültigkeit. Das Team lag am Ende der Saison eigentlich mit 45 Punkten auf dem neunten Tabellenplatz.