# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 Bayern München II, Deutschland Bayern München II 9 7 1 1 24:6 18 22
2 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 8 5 3 0 11:4 7 18
3 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 8 5 1 2 11:7 4 16
4 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 9 4 2 3 17:19 -2 14
5 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 9 2 6 1 13:12 1 12
6 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 8 3 3 2 11:10 1 12
7 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 8 3 2 3 12:10 2 11
8 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 8 2 5 1 12:12 0 11
9 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 8 3 2 3 14:15 -1 11
10 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 8 3 1 4 12:13 -1 10
11 FC Pipinsried, Deutschland FC Pipinsried 8 3 1 4 10:16 -6 10
12 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 7 2 3 2 6:5 1 9
13 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 8 2 2 4 9:12 -3 8
14 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 8 2 2 4 11:17 -6 8
15 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 7 2 1 4 11:12 -1 7
16 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 8 2 0 6 3:17 -14 6
17 FC Ingolstadt 04 II, Deutschland FC Ingolstadt 04 II 7 1 2 4 8:13 -5 5
18 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 8 1 2 5 7:18 -11 5
  Playoffs
  Relegation
  Abstieg

# Durch den Abstieg der Profimannschaft des FC Ingolstadt 04 in die 3. Liga wurde der FC Ingolstadt 04 II mit 0 Punkten an das Ende der Tabelle gesetzt. Die erspielten Ergebnisse behalten aber ihre Gültigkeit. Das Team lag am Ende der Saison eigentlich mit 45 Punkten auf dem neunten Tabellenplatz.