# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 11 6 3 2 14:6 8 21 1.91
2 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 12 6 4 2 13:6 7 22 1.83
3 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 11 6 2 3 12:8 4 20 1.82
4 TSV Aubstadt, Deutschland TSV Aubstadt 11 5 3 3 11:7 4 18 1.64
5 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 11 5 3 3 10:11 -1 18 1.64
6 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 11 5 2 4 9:6 3 17 1.55
7 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 11 4 3 4 9:8 1 15 1.36
8 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 11 3 6 2 5:4 1 15 1.36
9 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 11 3 5 3 5:6 -1 14 1.27
10 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 12 3 6 3 9:11 -2 15 1.25
11 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 12 4 3 5 5:7 -2 15 1.25
12 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 12 3 5 4 8:7 1 14 1.17
13 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 11 4 0 7 10:15 -5 12 1.09
14 TSV 1896 Rain, Deutschland TSV 1896 Rain 12 2 6 4 4:7 -3 12 1.00
15 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 11 2 4 5 3:6 -3 10 0.91
16 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 11 2 4 5 7:12 -5 10 0.91
17 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 11 3 1 7 7:14 -7 10 0.91
18 Türkgücü München, Deutschland Türkgücü München 0 0 0 0 0:0 0 0
  Playoffs
  Playoffs
  Abstieg

# Im Zuge der Unterbrechung durch die Corona-Epidemie und der späteren Fortführung der Liga hatte der Bayerische Fußball-Verband beschlossen, alle Spiele von Türkgücü München (Aufsteiger in die 3. Liga 2020/2021) aus der Wertung der gesamten Spielzeit zu nehmen.

# Wegen der Coronavirus-Pandemie konnte die Saison nicht zu Ende gespielt werden. Stattdessen wurden Playoffs zwischen Bayreuth, Schweinfurt und Aschaffenburg angesetzt, um den für die Aufstiegsrunde zur 3. Liga berechtigten Verein zu ermittteln.