# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 12 6 5 1 12:6 6 23 1.92
2 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 12 5 6 1 13:7 6 21 1.75
3 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 12 6 3 3 11:7 4 21 1.75
4 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 11 5 4 2 13:6 7 19 1.73
5 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 11 6 0 5 13:16 -3 18 1.64
6 TSV Aubstadt, Deutschland TSV Aubstadt 11 4 4 3 10:9 1 16 1.45
7 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 11 4 3 4 7:6 1 15 1.36
8 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 11 4 3 4 13:14 -1 15 1.36
9 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 11 4 3 4 10:11 -1 15 1.36
10 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 11 3 5 3 10:4 6 14 1.27
11 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 11 3 5 3 7:7 0 14 1.27
12 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 12 5 0 7 13:12 1 15 1.25
13 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 11 3 4 4 8:11 -3 13 1.18
14 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 11 3 2 6 9:15 -6 11 1.00
15 TSV 1896 Rain, Deutschland TSV 1896 Rain 12 1 7 4 5:11 -6 10 0.83
16 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 11 1 6 4 6:9 -3 9 0.82
17 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 11 1 4 6 6:15 -9 7 0.64
18 Türkgücü München, Deutschland Türkgücü München 0 0 0 0 0:0 0 0
  Playoffs
  Playoffs
  Abstieg

# Im Zuge der Unterbrechung durch die Corona-Epidemie und der späteren Fortführung der Liga hatte der Bayerische Fußball-Verband beschlossen, alle Spiele von Türkgücü München (Aufsteiger in die 3. Liga 2020/2021) aus der Wertung der gesamten Spielzeit zu nehmen.

# Wegen der Coronavirus-Pandemie konnte die Saison nicht zu Ende gespielt werden. Stattdessen wurden Playoffs zwischen Bayreuth, Schweinfurt und Aschaffenburg angesetzt, um den für die Aufstiegsrunde zur 3. Liga berechtigten Verein zu ermittteln.