# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 21 11 6 4 23:11 12 39 1.86
2 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 20 10 6 4 25:14 11 36 1.80
3 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 21 10 6 5 22:9 13 36 1.71
4 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 21 9 8 4 22:11 11 35 1.67
5 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 21 9 6 6 18:10 8 33 1.57
6 TSV Aubstadt, Deutschland TSV Aubstadt 20 7 7 6 15:12 3 28 1.40
7 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 20 6 9 5 9:9 0 27 1.35
8 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 21 7 7 7 15:18 -3 28 1.33
9 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 21 7 7 7 10:14 -4 28 1.33
10 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 21 6 9 6 13:11 2 27 1.29
11 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 21 5 10 6 13:11 2 25 1.19
12 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 18 6 3 9 13:21 -8 21 1.17
13 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 20 4 9 7 10:16 -6 21 1.05
14 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 19 4 8 7 6:14 -8 20 1.05
15 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 21 5 7 9 16:25 -9 22 1.05
16 TSV 1896 Rain, Deutschland TSV 1896 Rain 21 3 9 9 7:17 -10 18 0.86
17 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 21 4 5 12 9:23 -14 17 0.81
18 Türkgücü München, Deutschland Türkgücü München 0 0 0 0 0:0 0 0
  Playoffs
  Playoffs
  Abstieg

# Im Zuge der Unterbrechung durch die Corona-Epidemie und der späteren Fortführung der Liga hatte der Bayerische Fußball-Verband beschlossen, alle Spiele von Türkgücü München (Aufsteiger in die 3. Liga 2020/2021) aus der Wertung der gesamten Spielzeit zu nehmen.

# Wegen der Coronavirus-Pandemie konnte die Saison nicht zu Ende gespielt werden. Stattdessen wurden Playoffs zwischen Bayreuth, Schweinfurt und Aschaffenburg angesetzt, um den für die Aufstiegsrunde zur 3. Liga berechtigten Verein zu ermittteln.