# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 22 14 2 6 48:27 21 44 2.00
2 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 22 12 7 3 51:25 26 43 1.95
3 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 22 11 7 4 48:27 21 40 1.82
4 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 21 11 5 5 44:25 19 38 1.81
5 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 22 10 5 7 29:23 6 35 1.59
6 TSV Aubstadt, Deutschland TSV Aubstadt 21 9 6 6 36:31 5 33 1.57
7 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 22 9 7 6 40:23 17 34 1.55
8 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 21 8 7 6 26:26 0 31 1.48
9 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 21 7 7 7 35:30 5 28 1.33
10 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 21 7 5 9 28:42 -14 26 1.24
11 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 22 7 5 10 27:31 -4 26 1.18
12 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 22 7 4 11 33:46 -13 25 1.14
13 TSV 1896 Rain, Deutschland TSV 1896 Rain 22 7 3 12 24:40 -16 24 1.09
14 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 22 7 2 13 37:48 -11 23 1.05
15 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 20 4 7 9 17:28 -11 19 0.95
16 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 22 6 3 13 28:52 -24 21 0.95
17 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 19 3 4 12 20:47 -27 13 0.68
18 Türkgücü München, Deutschland Türkgücü München 0 0 0 0 0:0 0 0
  Playoffs
  Playoffs
  Abstieg

# Im Zuge der Unterbrechung durch die Corona-Epidemie und der späteren Fortführung der Liga hatte der Bayerische Fußball-Verband beschlossen, alle Spiele von Türkgücü München (Aufsteiger in die 3. Liga 2020/2021) aus der Wertung der gesamten Spielzeit zu nehmen.

# Wegen der Coronavirus-Pandemie konnte die Saison nicht zu Ende gespielt werden. Stattdessen wurden Playoffs zwischen Bayreuth, Schweinfurt und Aschaffenburg angesetzt, um den für die Aufstiegsrunde zur 3. Liga berechtigten Verein zu ermittteln.