# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 22 12 6 4 25:12 13 42 1.91
2 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 21 10 7 4 26:15 11 37 1.76
3 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 22 10 8 4 23:11 12 38 1.73
4 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 22 10 7 5 22:9 13 37 1.68
5 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 22 9 6 7 18:11 7 33 1.50
6 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 21 7 9 5 10:9 1 30 1.43
7 TSV Aubstadt, Deutschland TSV Aubstadt 21 7 8 6 15:12 3 29 1.38
8 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 22 7 8 7 11:15 -4 29 1.32
9 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 22 6 10 6 13:11 2 28 1.27
10 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 22 7 7 8 16:20 -4 28 1.27
11 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 21 5 10 6 13:11 2 25 1.19
12 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 19 6 4 9 13:21 -8 22 1.16
13 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 21 5 9 7 11:16 -5 24 1.14
14 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 20 4 9 7 6:14 -8 21 1.05
15 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 22 5 8 9 16:25 -9 23 1.05
16 TSV 1896 Rain, Deutschland TSV 1896 Rain 22 3 9 10 7:18 -11 18 0.82
17 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 22 4 5 13 9:24 -15 17 0.77
18 Türkgücü München, Deutschland Türkgücü München 0 0 0 0 0:0 0 0
  Playoffs
  Playoffs
  Abstieg

# Im Zuge der Unterbrechung durch die Corona-Epidemie und der späteren Fortführung der Liga hatte der Bayerische Fußball-Verband beschlossen, alle Spiele von Türkgücü München (Aufsteiger in die 3. Liga 2020/2021) aus der Wertung der gesamten Spielzeit zu nehmen.

# Wegen der Coronavirus-Pandemie konnte die Saison nicht zu Ende gespielt werden. Stattdessen wurden Playoffs zwischen Bayreuth, Schweinfurt und Aschaffenburg angesetzt, um den für die Aufstiegsrunde zur 3. Liga berechtigten Verein zu ermittteln.