# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 1. FC Magdeburg, Deutschland 1. FC Magdeburg 9 6 1 2 17:6 11 19
2 SV Wilhelmshaven, Deutschland SV Wilhelmshaven 9 5 3 1 14:9 5 18
3 VfL Wolfsburg II, Deutschland VfL Wolfsburg II 9 5 2 2 16:8 8 17
4 SV Babelsberg 03, Deutschland SV Babelsberg 03 8 5 2 1 10:4 6 17
5 Holstein Kiel, Deutschland Holstein Kiel 8 5 2 1 9:6 3 17
6 Hansa Rostock II, Deutschland Hansa Rostock II 9 5 1 3 14:13 1 16
7 VfB Lübeck, Deutschland VfB Lübeck 9 4 2 3 15:11 4 14
8 VFC Plauen, Deutschland VFC Plauen 9 4 2 3 15:13 2 14
9 Hertha BSC II, Deutschland Hertha BSC II 9 4 2 3 10:10 0 14
10 Türkiyemspor Berlin, Deutschland Türkiyemspor Berlin 8 4 1 3 9:9 0 13
11 Hallescher FC, Deutschland Hallescher FC 8 2 6 0 8:6 2 12
12 FC Oberneuland, Deutschland FC Oberneuland 8 3 2 3 9:8 1 11
13 Altona 93, Deutschland Altona 93 8 3 2 3 10:13 -3 11
14 Chemnitzer FC, Deutschland Chemnitzer FC 8 2 4 2 9:9 0 10
15 Hamburger SV II, Deutschland Hamburger SV II 8 1 4 3 7:11 -4 7
16 Hannover 96 II, Deutschland Hannover 96 II 8 2 1 5 9:14 -5 7
17 Sachsen Leipzig, Deutschland Sachsen Leipzig 9 1 3 5 3:13 -10 6
18 Energie Cottbus II, Deutschland Energie Cottbus II 9 1 2 6 4:16 -12 5
  Aufstieg
  Abstieg

# Sachsen Leipzig hat am 4. März 2009 einen Insolvenzantrag gestellt. Der Verein steht damit als erster Absteiger aus der Regionalliga Nord fest.

# Altona 93 erhält keine Lizenz für die Saison 2009/2010 und steht damit als Absteiger fest.

# Türkiyemspor Berlin hält trotz Rang 15 die Klasse, da Kickes Emden nach dem Lizenzrückzug für die 3. Liga in der Saison 2009/2010 in der Oberliga startet.