# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SV Babelsberg 03, Deutschland SV Babelsberg 03 12 8 3 1 19:6 13 27
2 1. FC Magdeburg, Deutschland 1. FC Magdeburg 13 8 2 3 22:12 10 26
3 Holstein Kiel, Deutschland Holstein Kiel 12 7 4 1 17:8 9 25
4 Hansa Rostock II, Deutschland Hansa Rostock II 13 7 3 3 22:18 4 24
5 Hertha BSC II, Deutschland Hertha BSC II 13 7 3 3 16:13 3 24
6 Hallescher FC, Deutschland Hallescher FC 12 5 7 0 12:6 6 22
7 VfL Wolfsburg II, Deutschland VfL Wolfsburg II 13 6 2 5 22:14 8 20
8 VfB Lübeck, Deutschland VfB Lübeck 13 5 5 3 19:14 5 20
9 SV Wilhelmshaven, Deutschland SV Wilhelmshaven 13 5 4 4 16:16 0 19
10 FC Oberneuland, Deutschland FC Oberneuland 12 5 3 4 16:12 4 18
11 VFC Plauen, Deutschland VFC Plauen 13 5 3 5 25:27 -2 18
12 Chemnitzer FC, Deutschland Chemnitzer FC 12 3 6 3 12:11 1 15
13 Hamburger SV II, Deutschland Hamburger SV II 12 3 5 4 13:12 1 14
14 Türkiyemspor Berlin, Deutschland Türkiyemspor Berlin 12 4 2 6 11:16 -5 14
15 Altona 93, Deutschland Altona 93 12 4 2 6 13:21 -8 14
16 Hannover 96 II, Deutschland Hannover 96 II 12 3 3 6 14:19 -5 12
17 Sachsen Leipzig, Deutschland Sachsen Leipzig 13 2 4 7 7:22 -15 10
18 Energie Cottbus II, Deutschland Energie Cottbus II 13 2 3 8 6:20 -14 9
  Aufstieg
  Abstieg

# Sachsen Leipzig hat am 4. März 2009 einen Insolvenzantrag gestellt. Der Verein steht damit als erster Absteiger aus der Regionalliga Nord fest.

# Altona 93 erhält keine Lizenz für die Saison 2009/2010 und steht damit als Absteiger fest.

# Türkiyemspor Berlin hält trotz Rang 15 die Klasse, da Kickes Emden nach dem Lizenzrückzug für die 3. Liga in der Saison 2009/2010 in der Oberliga startet.