# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SV Babelsberg 03, Deutschland SV Babelsberg 03 4 4 0 0 6:0 6 12
2 Holstein Kiel, Deutschland Holstein Kiel 4 3 0 1 5:4 1 9
3 VFC Plauen, Deutschland VFC Plauen 4 2 2 0 7:4 3 8
4 VfB Lübeck, Deutschland VfB Lübeck 4 2 1 1 9:5 4 7
5 FC Oberneuland, Deutschland FC Oberneuland 4 2 1 1 4:3 1 7
6 Hallescher FC, Deutschland Hallescher FC 4 1 3 0 4:3 1 6
7 Altona 93, Deutschland Altona 93 4 2 0 2 8:10 -2 6
8 Hertha BSC II, Deutschland Hertha BSC II 4 2 0 2 4:6 -2 6
9 Hansa Rostock II, Deutschland Hansa Rostock II 4 2 0 2 5:9 -4 6
10 VfL Wolfsburg II, Deutschland VfL Wolfsburg II 4 1 2 1 6:4 2 5
11 Hamburger SV II, Deutschland Hamburger SV II 4 1 2 1 5:5 0 5
12 SV Wilhelmshaven, Deutschland SV Wilhelmshaven 4 1 2 1 3:6 -3 5
13 Sachsen Leipzig, Deutschland Sachsen Leipzig 4 1 2 1 2:5 -3 5
14 1. FC Magdeburg, Deutschland 1. FC Magdeburg 4 1 1 2 3:3 0 4
15 Chemnitzer FC, Deutschland Chemnitzer FC 4 0 2 2 4:6 -2 2
16 Türkiyemspor Berlin, Deutschland Türkiyemspor Berlin 4 0 1 3 2:7 -5 1
17 Energie Cottbus II, Deutschland Energie Cottbus II 4 0 0 4 0:5 -5 0
18 Hannover 96 II, Deutschland Hannover 96 II 4 0 0 4 2:9 -7 0
  Aufstieg
  Abstieg

# Sachsen Leipzig hat am 4. März 2009 einen Insolvenzantrag gestellt. Der Verein steht damit als erster Absteiger aus der Regionalliga Nord fest.

# Altona 93 erhält keine Lizenz für die Saison 2009/2010 und steht damit als Absteiger fest.

# Türkiyemspor Berlin hält trotz Rang 15 die Klasse, da Kickes Emden nach dem Lizenzrückzug für die 3. Liga in der Saison 2009/2010 in der Oberliga startet.