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| 17.10.2008 | 19:00 | Energie Cottbus II | - | VfL Wolfsburg II | 0:1 (0:1) | |
| 18.10.2008 | 13:00 | FC Oberneuland | - | Hallescher FC | 1:1 (1:0) | |
| 14:00 | Altona 93 | - | Hertha BSC II | 3:0 (0:0) | ||
| 14:00 | 1. FC Magdeburg | - | VFC Plauen | 0:0 (0:0) | ||
| 14:00 | VfB Lübeck | - | Hansa Rostock II | 3:3 (0:2) | ||
| 14:00 | Chemnitzer FC | - | SV Babelsberg 03 | 1:2 (0:1) | ||
| 14:00 | Türkiyemspor Berlin | - | Hamburger SV II | 0:2 (0:0) | ||
| 19.10.2008 | 14:00 | SV Wilhelmshaven | - | Sachsen Leipzig | 0:0 (0:0) | |
| 14:00 | Hannover 96 II | - | Holstein Kiel | 1:3 (0:2) |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
SV Babelsberg 03 | 8 | 7 | 1 | 0 | 12:2 | 10 | 22 |
| 2 |
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Holstein Kiel | 8 | 7 | 0 | 1 | 16:6 | 10 | 21 |
| 3 |
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Hallescher FC | 8 | 4 | 4 | 0 | 9:5 | 4 | 16 |
| 4 |
|
Hamburger SV II | 8 | 4 | 3 | 1 | 13:6 | 7 | 15 |
| 5 |
|
1. FC Magdeburg | 8 | 4 | 1 | 3 | 8:6 | 2 | 13 |
| 6 |
|
SV Wilhelmshaven | 8 | 3 | 4 | 1 | 11:10 | 1 | 13 |
| 7 |
|
VfL Wolfsburg II | 8 | 3 | 2 | 3 | 10:7 | 3 | 11 |
| 8 |
|
VFC Plauen | 8 | 2 | 5 | 1 | 10:8 | 2 | 11 |
| 9 |
|
FC Oberneuland | 8 | 3 | 2 | 3 | 7:7 | 0 | 11 |
| 10 |
|
Hannover 96 II | 8 | 3 | 1 | 4 | 11:12 | -1 | 10 |
| 11 |
|
Altona 93 | 8 | 3 | 1 | 4 | 13:16 | -3 | 10 |
| 12 |
|
Hansa Rostock II | 8 | 3 | 1 | 4 | 12:17 | -5 | 10 |
| 13 |
|
VfB Lübeck | 8 | 2 | 3 | 3 | 11:9 | 2 | 9 |
| 14 |
|
Sachsen Leipzig | 8 | 1 | 4 | 3 | 3:8 | -5 | 7 |
| 15 |
|
Hertha BSC II | 8 | 2 | 1 | 5 | 6:17 | -11 | 7 |
| 16 |
|
Chemnitzer FC | 8 | 1 | 2 | 5 | 12:13 | -1 | 5 |
| 17 |
|
Türkiyemspor Berlin | 8 | 1 | 2 | 5 | 6:13 | -7 | 5 |
| 18 |
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Energie Cottbus II | 8 | 0 | 1 | 7 | 3:11 | -8 | 1 |
| Aufstieg | |
| Abstieg |
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# Sachsen Leipzig hat am 4. März 2009 einen Insolvenzantrag gestellt. Der Verein steht damit als erster Absteiger aus der Regionalliga Nord fest. # Altona 93 erhält keine Lizenz für die Saison 2009/2010 und steht damit als Absteiger fest. # Türkiyemspor Berlin hält trotz Rang 15 die Klasse, da Kickes Emden nach dem Lizenzrückzug für die 3. Liga in der Saison 2009/2010 in der Oberliga startet. |
