# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SSV Ulm 1846, Deutschland SSV Ulm 1846 8 5 3 0 13:4 9 18
2 1. FC Heidenheim 1846, Deutschland 1. FC Heidenheim 1846 8 5 2 1 16:9 7 17
3 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 8 5 1 2 17:8 9 16
4 Hessen Kassel, Deutschland Hessen Kassel 8 4 3 1 18:8 10 15
5 Eintracht Frankfurt II, Deutschland Eintracht Frankfurt II 8 4 3 1 15:7 8 15
6 Waldhof Mannheim, Deutschland Waldhof Mannheim 8 5 0 3 15:12 3 15
7 SC Pfullendorf, Deutschland SC Pfullendorf 8 4 2 2 11:11 0 14
8 SV Wehen Wiesbaden II, Deutschland SV Wehen Wiesbaden II 8 4 1 3 13:7 6 13
9 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 8 3 2 3 7:6 1 11
10 1. FC Eintracht Bamberg, Deutschland 1. FC Eintracht Bamberg 8 3 1 4 19:24 -5 10
11 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 8 2 3 3 9:10 -1 9
12 SV Darmstadt 98, Deutschland SV Darmstadt 98 8 2 3 3 10:13 -3 9
13 TSV Großbardorf, Deutschland TSV Großbardorf 8 2 2 4 12:18 -6 8
14 SSV Reutlingen, Deutschland SSV Reutlingen 8 2 2 4 11:17 -6 8
15 TSV 1860 München II, Deutschland TSV 1860 München II 8 1 4 3 8:11 -3 7
16 Karlsruher SC II, Deutschland Karlsruher SC II 8 1 3 4 11:14 -3 6
17 SpVgg Unterhaching II, Deutschland SpVgg Unterhaching II 8 1 2 5 11:21 -10 5
18 SC Freiburg II, Deutschland SC Freiburg II 8 0 1 7 5:21 -16 1
  Aufstieg
  Abstieg

# Das Spiel Unterhaching II - 1860 II (25. Spieltag) wurde wegen des Einsatzes eines nicht spielberechtigten Spielers mit 0:2 gewertet.

# Viktoria Aschaffenburg hat aus finanziellen Gründen keine Lizenz für die Saison 2009/2010 beantragt und steht damit als Absteiger fest.