1. Spieltag 02.08.2003 KFC Uerdingen 05 - Wuppertaler SV 0:3
2. Spieltag 09.08.2003 Wuppertaler SV - Eintracht Braunschweig 1:1
3. Spieltag 16.08.2003 SG Wattenscheid 09 - Wuppertaler SV 0:2
4. Spieltag 23.08.2003 Wuppertaler SV - FC St. Pauli 3:0
6. Spieltag 06.09.2003 Wuppertaler SV - Preußen Münster 2:1
5. Spieltag 10.09.2003 Dynamo Dresden - Wuppertaler SV 3:0
7. Spieltag 13.09.2003 Wuppertaler SV - Hamburger SV II 2:0
8. Spieltag 20.09.2003 Holstein Kiel - Wuppertaler SV 1:1
9. Spieltag 26.09.2003 Wuppertaler SV - Rot-Weiss Essen 2:0
10. Spieltag 05.10.2003 Chemnitzer FC - Wuppertaler SV 1:2
11. Spieltag 11.10.2003 Wuppertaler SV - SC Paderborn 07 0:3 gelbe Karte
12. Spieltag 18.10.2003 FC Schalke 04 II - Wuppertaler SV 0:2
13. Spieltag 25.10.2003 Wuppertaler SV - Borussia Dortmund II 1:1
14. Spieltag 02.11.2003 Sachsen Leipzig - Wuppertaler SV 4:0
15. Spieltag 08.11.2003 Wuppertaler SV - 1. FC Köln II 3:0 Tor
16. Spieltag 15.11.2003 Werder Bremen II - Wuppertaler SV 0:1
17. Spieltag 22.11.2003 Wuppertaler SV - VfR Neumünster 1:1
18. Spieltag 29.11.2003 Wuppertaler SV - KFC Uerdingen 05 3:1 Tor
19. Spieltag 07.12.2003 Eintracht Braunschweig - Wuppertaler SV 0:1 gelbe Karte
21. Spieltag 06.03.2004 FC St. Pauli - Wuppertaler SV 1:2
22. Spieltag 13.03.2004 Wuppertaler SV - Dynamo Dresden 1:1
23. Spieltag 21.03.2004 Preußen Münster - Wuppertaler SV 1:1
20. Spieltag 30.03.2004 Wuppertaler SV - SG Wattenscheid 09 0:1 gelbe Karte
25. Spieltag 03.04.2004 Wuppertaler SV - Holstein Kiel 2:1
24. Spieltag 06.04.2004 Hamburger SV II - Wuppertaler SV 0:1 Tor
26. Spieltag 10.04.2004 Rot-Weiss Essen - Wuppertaler SV 5:2
27. Spieltag 17.04.2004 Wuppertaler SV - Chemnitzer FC 1:2
28. Spieltag 24.04.2004 SC Paderborn 07 - Wuppertaler SV 0:0
29. Spieltag 01.05.2004 Wuppertaler SV - FC Schalke 04 II 1:1