| 3. Spieltag | 28.08.2005 | Energie Cottbus | - | SC Paderborn 07 | 1:2 | ||||
| 13. Spieltag | 18.11.2005 | SC Paderborn 07 | - | Sportfreunde Siegen | 4:0 | ||||
| 14. Spieltag | 27.11.2005 | Alemannia Aachen | - | SC Paderborn 07 | 2:1 |  |
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| 17. Spieltag | 19.12.2005 | SC Paderborn 07 | - | Karlsruher SC | 2:0 | ||||
| 21. Spieltag | 12.02.2006 | LR Ahlen | - | SC Paderborn 07 | 0:2 | ||||
| 22. Spieltag | 19.02.2006 | SC Paderborn 07 | - | Hansa Rostock | 3:0 |  |
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| 23. Spieltag | 24.02.2006 | SpVgg Greuther Fürth | - | SC Paderborn 07 | 1:1 | ||||
| 24. Spieltag | 05.03.2006 | SC Paderborn 07 | - | Dynamo Dresden | 0:2 | ||||
| 25. Spieltag | 10.03.2006 | Kickers Offenbach | - | SC Paderborn 07 | 1:1 | ||||
| 26. Spieltag | 19.03.2006 | SC Paderborn 07 | - | TSV 1860 München | 0:1 | ||||
| 27. Spieltag | 24.03.2006 | Eintracht Braunschweig | - | SC Paderborn 07 | 2:0 | ||||
| 28. Spieltag | 31.03.2006 | SC Paderborn 07 | - | VfL Bochum | 1:3 | ||||
| 29. Spieltag | 09.04.2006 | SC Freiburg | - | SC Paderborn 07 | 1:0 | |
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| 30. Spieltag | 13.04.2006 | Sportfreunde Siegen | - | SC Paderborn 07 | 0:2 | |
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| 31. Spieltag | 21.04.2006 | SC Paderborn 07 | - | Alemannia Aachen | 3:1 | ||||
| 32. Spieltag | 02.05.2006 | Wacker Burghausen | - | SC Paderborn 07 | 5:1 | |
Deutschland
